上海水运交通十分便利，水路航线素有“黄金水道”之称。上海港是中国的第一大港，也是世界第三大港和世界著名的十大港口之一，是我国唯一兼有海运、江运和内河航运的客运港口。上海港是出入上海市的一个重要门户，是华东地区的水上客运枢纽，航运客轮溯长江而上可达九江、武汉和重庆，沿近海而行，则又可至青岛、大连、宁波。另外，上海与韩国仁川、釜山，日本大阪、神户开通了海上客运航线，从上海港出发的国际海运客货轮，可达世界上160多个国家各地区400多个港口。
上海港国际客运中心码头（又称“一滴水”）东起高阳路，西至虹口港，北沿东大名路，南到黄浦江。目前，客运中心水路由三部分组成：上海沿海客运码头、上海三岛（崇明、长兴、横沙）客运码头、上海三岛车客渡码头。沿海客运码头基本继承了原十六铺客运码头的航线，有开往定海、普陀山、南通、舟山、岱山以及长江沿岸城市等多条航线。国际客运中心码头地址：上海市东大名路358号国际客运中心码头电话：021-61819900
上海港吴淞客运中心码头位于宝山区，作为上海中型交通枢纽，以水运为主。上海市内有多趟公交车可以抵达吴淞码头，包括：淞嘉线（吴淞码头-嘉定客运中心）、淞马线（吴淞码头-封周路）、永罗线（吴淞码头-罗店汽车站）、淞泾专线（吴淞码头-长发路）、522（吴淞码头-兰陵路）、968（吴淞码头-塘桥）。吴淞码头客运站地址：上海市宝山区淞浦路114号吴淞码头客运站电话：021-56575500；021-56671205
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