外部交通
飞机：敦煌机场位于敦煌市东13公里处，现开通有北京、西安、兰州、成都、重庆、嘉峪关、南京、乌鲁木齐、上海、花土沟、天津、张掖、广州、香港等城市的固定航线，有淡旺季之分。从机场到市区，可乘坐出租车，费用在30～40元之间。
火车：敦煌现有两火车站，柳园站在敦煌市西北方向128 公里处，可乘火车至柳园站再转乘汽车到 敦煌。可直达上海、北京西、西安、成都、兰州，乌鲁木齐等数十个城市；从柳园站到敦煌市区，不分昼夜都有汽车，中巴15 元，2 小时到达。拼车30 元 左右一人，出租车100 元左右， 1小时到达。
敦煌市火车站，在敦煌市东10公里处，乘大巴公交车3路即可到达市区。敦煌铁路连接敦煌与瓜州县柳沟站，从嘉峪关到敦煌全程400多公里，运行时间5小时左右。现有三个车次：K591嘉峪关4:56发车，9:30到敦煌；K9667次3:33 发车，8:19到达，是从兰州始发的；7527次7:22出发，12:49到达。另外兰州到敦煌有两趟列车，分别是K9667次和K591次，都是夕发朝 至的车。
此外还有西安－敦煌（K591/K592次），兰州－敦煌（N857/N858）的列车可抵敦煌车站。
内部交通
公交：敦煌的公交车线路较少，市内交通以人力车及自行车为主。公交车最实用的有2 条，均位于市中心鸣山路上（敦煌饭店附近）。3 路车可直达鸣沙山，票价 1 元。空调车票价2 元。敦煌市区到莫高窟的公交车，在汽车站以北、西域路口的敦煌饭店发车，经丝路宾馆、敦煌火车站到莫高窟，半小时一般，票价 8 元。莫高窟返回市区的末班车是18：00。
出租车：敦煌出租车昼夜服务。夏利车起步价5 元，桑塔纳起步价10 元。包车可到沙洲大酒店十字路口，或鸣沙路市政府招待所南的小十字路口处，那里是出租车聚集的主要地方。