北京中医医院始建于1956年，是北京市唯一的一所市属综合性、现代化三级甲等中医医院。承担着北京市中医医疗、教学、科研、预防等任务。医院下设北京市中医药研究所、北京市赵炳南皮肤病研究中心、北京市中医国际交流培训中心等，是首都医科大学中医药临床医学院、北京中医药大学教学医院、北京市中医住院医师（全科医生）规范化培训基地。目前，北京中医医院分别被国家中医药管理局评为治未病基地、国家中医疫病防治及紧急医学救援基地、中医药国际合作基地、中医急诊临床基地、中医适宜技术推广基地、中医药标准化研究推广基地、全国中医医院信息化示范单位，为北京市基本医疗保险A类定点医疗机构。
编制床位1400张，开放床位680，全年门急诊量220万人次，中医专病门诊93个，开展中医诊疗技术项目77项，配备大型医疗设备近50种。现有职工1745人。国医大师3人，全国名中医5人，长江学者1人，岐黄学者2人，岐黄青年学者3人，首都国医名师35人；全国优秀中医临床人才25人、享受政府特殊津贴29人、北京市新世纪百千万工程市级人选7人、北京市卫生系统“十百千”人才16人、“215”人才20人，北京市中医药人才(125计划)44人。全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师44人、北京市老中医药专家学术经验继承工作指导老师59人、全国名老中医药专家传承工作室27个、北京市“薪火传承3+3”工作室站30个。
医院有赵炳南皮肤病研究中心、脾胃病中心、针灸中心、治未病中心及肿瘤医疗中心5个北京市临床中心；设有中医皮科、中医脾胃病科、中医心血管科、中医针灸、中医妇科、中医儿科及中医治未病中心7个北京市中医特色诊疗中心；中医皮肤病、中医脾胃病、中医外科及中医急诊（重症医学）4个国家中医药管理局华北区域诊疗中心。有临床科室33个，临床中医诊疗水平居国内外领先。目前，医院有国家中医药管理局重点学科8个、北京市重点学科5个；国家临床重点专科8个、国家中医药管理局优势专科13个、北京市中医管理局重点专科15个、北京市国家中医重点专科辐射工程项目首都核心专科6个。
中药房常备中药饮片近680种，诸多院内制剂来源于名老中医及专家的验方、秘方和科研成果，现有批准文号的院内制剂184种，其中中药制剂168种，丸、散、膏、颗粒、胶囊、洗剂、酊剂、油剂等近20种剂型，70余种为临床常用制剂。病房煎药室始终保留一人一方，直火砂锅煎药的传统煎药模式。
医院承担着本科生、硕士生、博士生的教学任务，有中医专科教研室22个，教授、副教授共209人，学科硕士培养点14个，博士培养点12个，博士生导师28人、硕士生导师102人。获科研成果奖240项，其中省部级以上科研奖95项。
医院对外合作医疗机构65家，涉及包括四川、青海、新疆、宁夏、内蒙古、云南、湖北、山西、山东、河南、河北以及京郊区县等地区，其中，在北京地区对顺义、延庆、怀柔三家中医医院进行托管。随着国家对“京津冀协同发展”工作的推进，我院已与14家河北省医疗机构建立了技术合作关系。