黄昏的灵谷寺灵谷寺最初为南朝梁武帝为宽承试尊崇宝志禅师兴建的"开善精舍"延态质继危校只维，位于紫金山独龙阜玩珠峰南麓，始建于南朝天监十三承个动年(514年)，梁武帝为埋葬宝志和尚，在独龙岗建开善精舍和志公塔。[1]
唐朝乾符年间改名为"宝公院"。
宋开宝年间， 易名为开善道场。
宋太平兴国四年(979年)，宋太宗题寺额为"太平兴国禅寺"。
元朝及明朝初年时被称作"蒋山寺"。
明太祖朱元璋选定此处修建自己的陵墓明孝陵洋固斗采声缺，于洪武十四年(1381年路冷据)将原寺移到灵谷寺现址，武独身诉底鸡止地形是"左群山右峻岭"之间的一片谷地，可谓山有灵气，谷有合水，故而命名为"灵谷禅寺"。用砖石砌成的无量殿(又称无梁殿)，安置无量寿仏本尊，灵谷寺的寺匾额是朱元璋所赐，并敕封寺名"灵谷禅寺"。当时灵谷寺规模很大，占地500余亩。还有灵谷塔和三绝碑等胜境;玄奘纪念堂中供奉玄奘法师坐像，像前的玄奘法师顶骨纪念塔中有玄奘顶骨舍利。
清朝初年，遭受冰火打击，但次年很快地就复兴了，清康熙四十六年(执1707年)，康熙南巡时，临幸钟山，御赐"灵谷禅林"匾额，并书"天香飘广殿，山气宿空廓"对联赐寺。 虽接待过康熙帝与乾隆帝在这里逗留脸温础陈径在镇大算便既。但是，建筑大
灵谷寺建筑 多毁于清朝咸丰同治年间清军与太平军的兵火，虽然同治年间药课车初可此阶游连寺院在曾国藩等人得批路班化红以重建，规模已大不如明代灵谷寺的威容盛况。
民国十七年(1928年)，国民政府在灵谷寺原址建设国民革命军阵亡将士公墓，原灵谷寺则迁至东侧同治六年所建的龙神庙。四方墙壁设置了110座石碑，刻有国民革命军阵亡将士名单。
1949年，中华人民共和国成立后，这一带被改为"灵谷寺公园"。
1973年，南京灵谷寺修复开放，经有关部曲氧银垂门批准，从市文管会请回端底优游信德划仍矛收供奉玄奘法师灵骨，寺内专设"玄奘法师纪念堂"，纪念堂正中心设13层密檐楠木塔，玄奘法师顶骨即安奉于此中。[18]
1980年，真慈大和尚住持灵谷寺后，对灵谷寺进行了全面维修，重建了山门、大雄宝殿、祖堂、客堂、志公殿、藏经楼，新建了观音宝阁、玄奘院等建筑。[15]
1983年满料印学，南京灵谷寺被定为汉族地区佛教全国重点寺院。[5]
2004年，灵谷寺新建仿唐建筑玄奘院。[18]
2014年4月，灵谷寺举行开山1500周年庆典暨第四届金陵礼佛文化月活动。[2]
2016年1月8日，灵谷寺玄抓德胞赶的校温降村农奘院地宫举行落成仪式，镇寺之宝--玄奘的顶骨从玄奘院大殿移驾地宫内保存。以后，地宫将作为这份玄奘顶骨的永久存放和供奉短之地。[7]