【位置面积】 南通市地处中国东部海岸线与长江交汇处、长江入海口北翼，集“黄金水道”“黄金海岸”于一身，素有“江海门户”之称。南临长江，经苏通大桥、崇启大桥、沪苏通公铁大桥三条跨江通道分别与苏州市、上海市跨江相连，东濒黄海，西北与盐城市接壤，西与泰州市为邻。地理范围为北纬31°41′06″～32°42′44″，东经120°11′47″ ～121°54′33″，南北跨距114.2千米，东西跨距158.8千米。陆域面积8001平方千米，海域面积8701平方千米。有长江干流岸线166千米，海岸线206千米。作为中国首批进一步对外开放的14个沿海港口城市之一，南通在长江三角洲城市群中具有独特的区位优势，被誉为“江海明珠”。
【地形地貌】 南通市三面环水，形似半岛。全境除长江边狼山一带为山丘地貌外，其余为平原，分为狼山浅丘区、海安里下河低洼潟湖沉积平原区、北岸古沙咀区、南通古河汊水网平原区、南部新三角洲平原区、三余海积低平原区、沿海海积平原及海滩与盐场区。地势低平，地表起伏较微，高程2～6.5米，自西北向东南略有倾斜。平原辽阔，河、江、海贯通，水网密布是其显著特征。军山海拔108.5米，为全市最高点。
【气候水文】 南通市属北亚热带海洋性季风气候，季风影响明显，四季分明，气候温和。年平均气温15℃左右，年平均日照时数1900～2100小时，年平均降水量1000～1200毫米。
南通市境内地势平坦，河沟成网。水系大致以通扬运河、如泰运河为界，北部为淮河流域，面积2200余平方千米；南部属长江流域，面积5700余平方千米。主要骨干河道（一级河道）有焦港河、如海运河、九圩港河、如泰运河、通扬运河、新通扬运河、通吕运河、通启运河、新江海河、北凌河、栟茶运河等，总长742.34千米；二级河道105条，总长1760.58千米。另有众多三、四级河道。各级河道交织成网，相互沟通，经长期建设与整治，形成能引、能蓄、能控制、能调度、能通航利用的河网水系。境内长江岸线166千米，江面呈喇叭形向东南方向伸展，主流水深-10米，区域一般1500米宽，年径流量9800亿立方米，年际变化不大。