南麂岛坐落于浙江温州平阳县鳌江口外30海里的东海海面。由大小23个岛屿组成，陆地总面积约12平方公里。因丰富的海洋生物资源，被国务院列为国家级海洋类型自然保护区之一；1998年12月成为我国第一个纳入联合国教科文组织世界生物圈保护网络的海洋类生物保护区。
面积19600公顷，1989年经平阳县人民政府批准建立，1990年被批准为国家级，主要保护对象为海洋贝藻类及生态环境。
本区地处台湾暖流与江浙沿岸流交汇和交替消涨的海区，属亚热带海洋季风气候。区内海洋生物物种繁多，区系成分复杂，自然生态系统保存良好，生物种类有很多：鱼类397种、虾类79种、蟹类128种，而贝藻品种之齐全居各海域之冠。本区已鉴定的海洋贝类有403种，其中19种为国内首次记录，海洋底栖藻类有174种，其中黑叶马尾藻为世界海洋藻类的新种，贝藻类种数约占全国的29% 以上。本区的贝藻类不仅种类丰富，而且还具有温、热带两种区系特征和地域上的断裂分布现象，堪称我国近海贝藻类的一个重要基因库。
目前这个岛上的贝类大约有412种，藻类有174种，其中19种藻类为国内首次发现，22种藻类被列为稀有种。