广州水上巴士共有14条航线，具体运营线路如下：
水巴S01 营运线路 金沙洲-黄沙（水上公交定制线路） 始发码头 金沙洲码头 黄沙码头 发班时间 上午 7:00、8:00 7:30、8:30 下午 17:00、18:00 17:30、18:30 1、金沙洲码头：工作日7:00时（首班船）、08:00时、17:00时、18:00时（末班船），共4班次。2、黄沙码头：工作日7:30时（首班船）、8:30时、17:30时、18:30时（末班船），共4班次。3、票价：10元/人次。定制说明：1.节假日不开设公交如约定制航班。2.通过“广州定制公交”APP或“广州水上公交”、“广州客轮”微信公众号预约。3.每航班预约满20人起发班，航班发出前3天可开始预约，提前24小时停止接受预约，客满则止。4.如遇规则调整，以“广州定制公交”APP公布信息为准。 水巴S02 营运线路 芳村-西堤-天字-中大（水上公交定制线路） 始发码头 芳村码头 中大码头 发班时间 上午 7:00、8:00 7:00、8:00 下午 17:00、18:00 17:00、18:00 1、芳村码头：工作日7:00时（首班船）、8:00时、17:00时、18:00时（末班船），共4班次。2、中大码头：工作日7:00时（首班船）、8:00时、17:00时、18:00时（末班船），共4班次。3、票价：20元/人次。定制说明：1.节假日不开设公交如约定制航班。2.通过“广州定制公交”APP或“广州水上公交”、“广州客轮”微信公众号预约。3.每航班预约满20人起发班，航班发出前3天可开始预约，提前24小时停止接受预约，客满则止。4.如遇规则调整，以“广州定制公交”APP公布信息为准。 水巴S02短线 营运线路 中大-天字 始发码头 中大码头 天字码头 首尾航班 首班船 7:00 7:30 尾班船 17:00 17:45 1、中大码头：7:00时（首班船）-17:00时（末班船）期间，逢正点发班，共11班次。2、天字码头：7:30时（首班船）-16:30时期间，逢半点发班，末班船设在17:45，共11班次。3、票价：2元/人次。 水巴S04 营运线路 鳌洲-西堤 始发码头 鳌洲码头 西堤码头 首尾航班 首班船 6:45 6:52 尾班船 20:15 20:30 1、鳌洲码头：6:45时（首班船）-20:15时（末班船）期间，逢00、15、30、45分发班，共55班次。2、西堤码头：6:52时（首班船）-20:30时（末班船）期间，逢08、22、38、52分发班，共55班次。3、票价：2元/人次。 水巴S05B 营运线路 深井-新洲 始发码头 深井码头 新洲码头 首尾航班 首班船 5:45 6:00 尾班船 21:45 22:00 1、深井码头：7:15-8:15及17:40-18:20 ，每20分钟一班次。2、新洲码头：7:25-8:05及17:50-18:30 ，每20分钟一班次。3、其他时段为每隔30分钟一班次。4、票价：2元/人次。 水巴S06 营运线路 黄沙-芳村 始发码头 黄沙码头 芳村码头 首尾航班 首班船 6:00 6:00 尾班船 22:00 22:00 1、黄沙码头：6:00时（首班船）-22:00时（末班船）间段，逢00、10、20、30、40、50分发班，共97班次。2、芳村码头：6:00时（首班船）-22:00时（末班船）间段，逢00、10、20、30、40、50分发班，共97班次。3、票价：2元/人次。 水巴S07 营运线路 天字-纺织 始发码头 天字码头 纺织码头 首尾航班 首班船 6:38 6:45 尾班船 18:52 19:00 1、天字码头：6:38时（首班船）-18:52时（末班船）期间，逢8、22、38、52分发班，共50班次。2、纺织码头：6:45时（首班船）-19:00时（末班船）期间，逢00、15、30、45分发班，共50班次。3、票价：2元/人次。 水巴S08 营运线路 堑口-省总 始发码头 堑口码头 省总码头 首尾航班 首班船 7:00 7:08 尾班船 18:30 18:40 1、堑口码头：7:00时（首班船）-18:30时（末班船）期间，逢00、15、30、45分发班，共47班次。2、省总码头：7:08时（首班船）-18:22时期间，逢08、22、38、52分发班，末班船为18:40，共47班次。3、票价：2元/人次。 水巴S09 营运线路 白蚬壳-白鹤洞 始发码头 白蚬壳码头 白鹤洞码头 首尾航班 首班船 7:00 7:10 尾班船 20:00 19:50 1、白蚬壳码头：7:00-9:00时及17:00-20:00时，每隔20分钟/班次。2、白鹤洞码头:7:10-8:50时及17:10-19:50时，每隔20分钟/班次。3、其他时段为每隔30分钟/班次。4、票价设置：2元/人次。 水巴S10 营运线路 鱼珠-长洲 始发码头 鱼珠码头 长洲码头 首尾航班 首班船 5:45 5:45 尾班船 23:50 24:00 1、7:00-9:00及17:00-19:00每10分钟一班次2、夜班船开行时间：鱼珠码头：22:00、22:30、23:10、23:50长洲码头：22:15、22:50、23:30、24:003、其他时段每隔15分钟一班次4、票价：2元/人次。 水巴S11 营运线路 海心沙-中大码头 始发码头 中大码头 海心沙码头 首尾航班 首班船 7:30 8:00 尾班船 17:30 18:00 1、中大码头：7:30时（首班船）-17:30时（末班船）期间，逢30分发班，共11班次。2、海心沙码头：8:00时（首班船）-18:00时（末班船）期间，逢00分发班，共11班次。3、票价：2元/人次。 水巴S12 营运线路 长洲-鱼珠-海心沙（水上公交定制线路） 始发码头 长洲码头 海心沙码头 发班时间 上午 7:00、7:30、8:00 / 下午 / 17:30、18:00、18:30 1、长洲码头：7:00时（首班船）-8:00时（末班船）期间，逢正点、半点发班，共3班次。2、海心沙码头：17:30时（首班船）-18:30时（末班船）期间，逢正点、半点发班，共3班次。3、票价：10元/人次。定制说明：1、通过“广州定制公交”APP或“广州水上公交”、“广州客轮”微信公众号预约。每航班预约满20人起发班，航班发出前3天可开始预约，提前24小时停止提受预约，客满则止。2、如遇规则调整，以“广州定制公交”APP公布信息为准。 水巴S13 营运线路 南浦锦绣半岛-黄沙 始发码头 南浦锦绣半岛码头 黄沙码头 首尾航班 首班船 7:05 7:05 尾班船 18:25 18:25 1、黄沙码头：7:05时（首班船）-8:25时,17:45时-18:25时（末班船）时间段，每隔40分钟一班次；9:00时-17:00时期间为平峰期，逢正点发班。共14班次。2、南浦码头：7:05时（首班船）-8:25时,17:45时-18:25时（末班船）时间段，每隔40分钟一班次；9:00时-17:00时期间为平峰期，逢正点发班。共14班次。3、票价：3元/人次。定制说明：1.工作日公交固定航班：南浦往黄沙方向（7:05/7:45）；黄沙往南浦方向（17:45/18:25），无需预约，节假日不开设公交固定航班。其余时段为如约定制航班，需预约。2.通过“广州定制公交”APP或“广州水上公交”、“广州客轮”微信公众号预约。3.每航班预约满10人起发班，航班发出前3天可开始预约，航班前一天20:00时停止接受预约，客满则止。4.如遇规则调整，以“广州定制公交”APP公布信息为准。 水巴S14 营运线路 石围塘-黄沙-坦尾-石围塘(水上公交定制线路） 始发码头 石围塘 发班时间 7：00-18:15 1、石围塘码头：7:00时（首班船）-18:15时（末班船）期间，每隔45分钟一班次，共16班次。2、票价：2元/人次。定制说明：1.通过“广州定制公交”APP或“广州水上公交”、“广州客轮”微信公众号预约。2.每航班预约满20人起发班，航班发出前3天可开始预约，提前24小时停止接受预约，客满则止。3.如遇规则调整，以“广州定制公交”APP公布信息为准。
说明：
1、水巴S05A（鱼珠-军校-新洲）航线2020年1月25日起暂停运营。
2、水巴公交航班单条线路票价为2元，水上公交定制线路航班、观光航班票价以实际为准。
3、如遇到恶劣天气或交通情况，水上巴士将会根据实际情况进行适当调整。
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