上海港位于我国大陆海岸线的中部，扼长江入海口，地处长江东西运输通道与海上南北运输通道的交汇点，是我国沿海最大的枢组港。港口北至青岛417海里、大连562海里；南至高雄614海里、厦门593海里、香港853海里、广州黄埔港区919海里。作为我国最大的综合性港口，上海港是我国对外交往，参与国际经济大循环最重要的口岸。港口距神户787海里、横滨1045海里、符拉迪沃斯托克（海参崴）997海里、新加坡2186海里、温哥华5076海里、圣弗朗西斯科（旧金山）5397海里、巴拿马8747海里。
上海港海港水域范围为长江上海段和杭州湾北岸水域、黄浦江水域、洋山港区水域，以及长江口外的长江口锚地水域、绿华山锚地水域，主要划分为：外高桥港区、宝山港区、黄浦江下游港区、黄浦江中游港区、黄浦江上游港区、金山及漕泾化工港区（杭州湾港区）、洋山港区、崇明三岛港区和临港新城港区。
外高桥港区，位于吴淞口以南的长江南岸，上海国际航运中心集装箱运输的核心港区之一，是以集装箱、油品运输为主，兼顾散、杂货运输的大型深水港区。
宝山港区，位于长江南岸吴淞口至新川沙河口，是以煤炭、矿石、钢铁等散杂货装卸、中转以及水上客运为主的大宗散货港区，主要为宝钢、石洞口电厂等大型临港工业服务。
黄浦江下游港区，位于杨浦大桥和吴淞口之间的黄浦江两岸，以张华浜、军工路、朱家门等公用码头为主，主要从事外贸件杂货、散货、集装箱、油品等货类装卸及水上客运，以形成公用和货主专用码头共同发展的格局。
黄浦江中游港区，位于卢浦大桥和杨浦大桥之间的黄浦江两岸城市中心区，自2003年以来，该港区货运功能根据城市发展要求逐步退出，重点发展客运、旅游、博览和公共服务。
黄浦江上游港区，位于卢浦大桥上游至闵行发电厂的黄浦江两岸，以龙吴港作业区为核心，已形成为临港工业服务的企业专用码头和公用码头共同发展格局，吞吐货物以煤炭、矿建、件杂货为主。
金山及漕泾化工港区（杭州湾港区），位于杭州湾北岸，现有码头设施主要分布于金山石化工业区和漕泾化工港区以及临港新城地区，是以服务后方企业的液体化工品、煤炭、重大件运输为主的综合性港区。
洋山港区，位于浙江省舟山境内嵊泗县洋山岛群中，是上海国际航运中心的集装箱深水枢组港区，是上海港参与国际竞争的核心港区，国际远洋集装箱班轮的主靠港。
崇明三岛港区，该港区为正在建设开发的新港区，港口设施主要分布于崇明、长兴、横沙三岛，其中长兴岛的发展目标是成为我国最大的造船基地，崇明岛、横沙岛为港口预留发展区。
临港新城港区，位于南汇嘴至芦潮港之间，该港区为上海正在建设的临港新城服务。
上海国际港务（集团）股份有限公司拥有分公司、全资子公司及控股公司多家，形成了包括码头物流、航运、陆运、引航、拖带、代理在内的港口服务产业链，承担着上海港公用码头的装卸任务。至2014年末，上海港海港拥有各类码头泊位1191个，码头总延长123．99千米，其中万吨级泊位251个，另有浮筒泊位62个，全港最大码头泊位设计靠泊能力为30万吨级。另外，在绿华山南锚地设有减载平台1座。
长江口深水航道是进出长江上海段水域及黄浦江的深水航道，包括长江口深水航道北槽航道和长江口深水航道延伸段。长江口深水航道北槽航道为自长江口船舶定线制A警戒区西侧边界线至圆圆沙警戒区东侧边界线之间的航道，总长约43海里。A警戒区西侧边界线至D12号灯浮航道底宽400米，设标宽度550米，D12灯浮至圆圆沙警戒区东侧边界线航道底宽350米，设标宽度500米。长江口深水航道延伸段自圆圆沙警戒区东侧边界线至浏河口港界线之间，总长约25海里，底宽350米～460米。长江口深水航道维护水深为理论最低潮面以下12．5米。
黄浦江内航道自吴淞口101号灯浮至闵行发电厂西界，全长67．2千米，航道水深10米以上的占80％，全线可通航水深为8米。
洋山港主航道大部分为水深大于20米的自然水深航道，航道全长约26．4海里，航道底宽450米～550米，经疏浚拓宽，现已实现完全双向通航。
上海港经济腹地辽阔，港口所在地上海市，是全国最大的经济、科技、贸易、金融、信息和文化中心。工业基础雄厚，冶金、机械、化工、电子、造船、仪器仪表、纺织、轻工、医药等轻、重工业门类齐全。上海市进出口的物资有60％～70％通过港口运输。上海港每年完成的货物吞吐量中的一半为上海市以外的经济腹地物资中转，经上海港中转货物的腹地省市包括江、浙、皖、赣、湘、鄂、川、渝8省市。这些省市是中国工农业比较发达的区域，其经济的主要特点：一是工农业发达的省市，如上海、江苏、浙江、湖北，缺少矿藏资源，需要大量调入工业原材料和燃料，调出工业产品；二是外贸进口量大于出口量，出口物资一般是价格较高，运量较小的工业品，缺少大宗散货，而进口则有大量的矿产品。
上海港所在的上海市作为全国最大的经济、贸易、金融中心，交通运输便捷，已形成以港口为中心海陆空相结合的现代综合立体式发达的交通网络。
公路：上海港各主要作业区都与市内道路衔接，并经204、312、318、320四条国道连通全国公路网。四通八达的公路运输为港口客货集疏起了极为重要和便利的作用。全市公路总里程达到11682千米，其中高速公路778千米，普通国省干线公路811千米，县道2340千米，农村公路7753千米，桥梁总数达到9493座，公路越江通道9处58车道。上海高速公路网全面覆盖延伸到上海市9个郊区及主要开发区、工业园区和航空港、深水港。上海与苏、浙两省衔接的高速公路已增加到8条，共48个车道。
铁路：京沪高速铁路的投人使用将我国长江三角洲与渤海两大经济区连接的更为紧密。华东地区已形成了京沪、京九、沪昆、陇海四大干线区段，以及符夹、水蚌、青阜、阜准、淮南、皖赣、宣杭、合九、新长、宁启、宁芜、芜铜、铜九、合宁、萧甬、金温等主要线路，上海为这些线路的枢纽站。同时还有诸多铁路支线密布于上海、安徽、江苏、浙江等地，干支相连，纵横交错，四通八达的铁路网遍布长江三角洲和江准地区。上海芦潮港铁路集装箱中心站，是全国18个铁路集装箱中心站之一。
水路：上海港依江临海，地理位置优越，水路交通便利。沿海北起丹东、大连、南至湛江、防城港均有航班；溯长江而上，可达沿江各港，是长江沿线地区与南北沿海地区水上运输的交汇点和货物中转换装的枢组；上海地处水网地带，内河运输发达，上海市共有内河航道210条，通航里程达2086．3千米，拥有80余万吨内河运力。其中通往外省市的干线航道8条，主要有苏申外港线、平申线、苏州河、蕰藻浜、长湖申线等。
上海港是著名的国际航运中心，与美国、加拿大、德国、荷兰、西班牙、意大利、比利时、日本、韩国、新加坡等世界上200多个国家或地区的500多个港口有贸易运输往来，已吸引了国内外70多家船公司加盟国际集装箱班轮航班的营运。截至2014年底，上海港集装箱班轮航班达到每月2000余班，其中，远洋航线500余班，近洋航线近600班，内支线和内贸航线每月1000余班。上海港先后与美国的西雅图、新奥尔良，日本的大阪、横滨，比利时的安特卫普等港口结成了友好港。2014年上海港全港完成货物吞吐量7．55亿吨，其中海港完成货物吞吐量6．69亿吨，外贸货物吞吐量3．82亿吨。随着洋山深水港三期工程的投产，集装箱的吞吐量也不断跃升，2014年上海港完成集装箱吞吐量3528．5万标准箱。同时，上海港的邮轮母港地位日益巩固，2014年上海港国际客运中心码头和吴淞邮轮港共接待国际邮轮靠泊269艘次，旅客吞吐量121．52万人次，世界著名邮轮企业皇家加勒比、歌诗达、丽星等公司齐聚上海港。
航空：上海是闻名世界的国际空港，市区有虹桥和浦东2个国际机场，国内航线遍及全国主要的大中城市，国外与美国、加拿大、日本、法国、意大利等国家的主要城市有固定航班。
随着洋山深水港不断建设与发展，上海市将根据建设上海国际航运中心的国家战略定位，以“稳固母港，走向世界”的模式，继续实施“长江战略、东北亚战略和国际化战略”。通过向长江合作港口输出管理、资本和技术，实现上海港与经济腹地的和谐共赢发展；通过提升母港服务能力和构建沿海公共支线平台，开拓东北亚集装箱中转市场，确立上海港在东北亚地区国际航运中心的地位。
水文气象潮汐 上海港大部分水域基本属非正规半日潮，由于各水域地理条件不同，潮汐值也略有不同。
长江上海段：
长江口地区的潮汐属非正规半日浅海潮，一天内高高潮与低高潮可相差0.5米～1.5米，落潮历时约6.5小时～8.5小时，自河口往上游沿程递增；涨潮历时约4小时～6小时，往上游递减。
河口附近平均潮差为2.9米，吴淞口2.3米，徐六泾2.1米，沿程递减。易受气象影响，一般强东北风时，潮高可增高0.4米～0.5米；强西北风时，可减0.2米～0.3米。绿华山南错地潮汐（潮汐以绿华站为准）属非正规半日潮，每天有两高两低，潮差最大可达5米左右。
黄浦江水域：
黄浦江的潮汐属不正规半日潮。吴淞最大潮差为4.4米，最高潮位5.7米，最低潮位-0.2米；黄浦公园处的最大潮差为3.5米，最高潮位5.2米，最低潮位0.2米，潮汐向上游方向沿程递减。黄浦江一般农历每月的初一和十五为大潮期间，其中以农历初三和十八为最大潮，而农历的初九、初十和甘五、甘六为最小潮。夏季，夜潮大于日潮。冬季，日潮大于夜潮。秋分前后，逢大潮将有特别高潮。黄浦江的潮汐与长江水位的高低有关系，长江枯水期（1月－3月）黄浦江潮位最低，长江洪水期（7月－9月）黄浦江潮位最高，影响最大时，潮位可增高0.2米左右。涨落潮亦受风影响，当刮强东北风时，涨潮提前，潮高增高，刮偏西风时，则相反。台风来临时，涨落潮有失常现象，台风过境后曾出现只有落潮的现象。
杭州湾北岸：
杭州湾属强潮海湾，外海传入的潮波经广阔平坦的杭州湾水下平原的摩阻，以及喇叭口形海湾地形的影响，潮波变化由湾口至湾顶逐渐增大，表现为潮差增大，涨落潮不对称，前坡陡、后坡缓，海区水文条件复杂。该海区潮属不正规的半日浅海潮，其日潮不等现象较为显著。湾口北角以南汇嘴为例，平均高潮间隙11时36分，平均低潮间隙06时01分，大潮升4.5米，小潮升3.4米，平均海面2.6米。湾中部以滩浒山为例，平均高潮间隙00时04分，平均低潮间隙06时45分，大潮升4.5米，小潮升3.5米，平均海面2.7米。
洋山港区：
洋山港区潮汐属非正规半日潮，据短期同步验潮资料和邻近长期潮位站资料分析，最高高潮位5.7米（9711号台风过程中），平均高潮位3.8米，平均潮位2.5米，平均低潮位1.1米，最低低潮位-0.1米（1998年1月30日），平均潮差2.7米。（洋山港区潮高基准面以小洋山理论最低潮位零点起算）
潮流 由于上海港各水城位于河口、沿岸以及外海的地理位置不同，潮流性质变化有明显差异。
长江上海段：
长江口滴海水域为顺时针方向回转流。最大涨潮流流速约3.8节，发生在中没高潮前4小时，为西北流；最大落潮流流速约4.8节左右，发生在中没高潮后2小时，为东南流。
长江口深水航道上溯（东经122°以西）均为往复流。底层流向基本与水道平行，表层流向与水道稍异，涨潮流偏北，落潮流偏南。一般情况下涨潮流始于当地高潮前3小时～4小时，最大流速4节左右（高潮前2小时）；落潮流始于当地高潮后2小时，最大流速3.5节左右。河口涨潮历时5.5小时左右，落潮历时7小时左右；河口往上涨潮历时沿程递减至浏河口附近为4.5小时，落潮流沿程递增至8小时左右，转流与憩流时间一般为半小时左右。各水道相对比较，北支水道流速最大，而且经常出现涨潮流大于落潮流现象。
绿华山南锚地流向基本为西北和东南的往复流，但在锚地各点因距岸边的距离不同而有所差异。最大流速出现在当地高潮前1.5小时～2小时，最大流速4节。
黄浦江水域：
黄浦江的潮流为往复流，流向与河道走向一致。水流平稳，仅陆家嘴附近水流急时产生寮流。潮流随季节和月份而变，夏季一般夜大于日，冬季日大于夜，降水和风对潮流亦有影响。流速一般2节～3节，最大涨潮流流速为3.5节，最大落潮流流速为2.9节。平均大潮涨潮流流速为2.6节，落潮流流速2.1节。平均小潮涨潮流流速1.4节，落潮流流速1.8节。高低潮时流速最大，可达4.5节。江中心转流时间比岸边迟0.5小时～1小时。
虬江码头附近转流时间比吴淞码头迟半小时左右。
苏州河口涨潮流始于吴淞低潮后2小时55分，落潮流始于吴淞高潮后3小时20分。接近低潮时流速最大，可达3节。
黄浦江潮流特点：
（1）东北风或偏东风，风力较大时（5级以上）涨潮流来得早；而南风或西风风力较大时（5级以上）涨潮流来得晚，落潮流时间长。当涨潮潮差大于落潮潮差，则涨潮流来得早；反之则晚。
（2）岸边转流时间比航道中央早30分～45分。
（3）岸边凸弯处涨、落潮流转流时间比凹弯处早。
（4）小潮时的涨潮流时间比大潮时要短，其转流时的平流时间长，且受风的影响大。
（5）黄浦公园涨潮流自吴淞低潮后2小时左右开始到高潮后2小时左右止。涨潮流流速最急在初涨潮1小时后开始，持续约2小时。
（6）黄浦公园落潮流自中浚高潮后5小时至吴淞低潮后30分～45分止。落潮流流速最急在初落潮1小时15分后开始，持续约3小时30分。
（7）在夏、秋两季，当雨水多的小潮汛期间，往往有水涨而流不来的现象，或涨潮流的时间短暂。当中浚涨潮潮差小于0.9米时，上海港黄浦江内无涨潮流。
（8）黄浦江潮流，在半日潮的12小时中，一涨一落的过程，平均涨潮流为5小时，而落潮流约为7小时，落潮流的时间大于涨潮流时间。
杭州湾北岸：
杭州湾受钱塘江泾流、长江口泾流影响，且湾口水域宽阔，风浪动力作用较强，流的变化较为复杂。金山化工码头1号、2号泊位附近水域在陈山高（低）潮时转流，也可参考淮浒山潮位，在滩浒山高（低）潮后0.5小时～1.5小时转流。在金山化工码头1号泊位西边、2号泊位东边是一片回淤区，挖泥后，此处水域回淤较快。涨潮历时一般为5小时20分，落潮历时一般为7小时05分。煤码头外档附近水域表层最大涨潮流流速4节，流向253°；落潮流流速3.9节，流向061°。最大涨潮流发生在涨潮开始后1.5小时～2.0小时，最大落潮流出现在落潮开始后2.0小时～2.5小时。
洋山港区：
洋山港区附近海域潮流基本为往复流，其中位于航道或岛屿边缘受地形制约，水流呈明显的往复流性质，而位于相对离岛屿较远、水域开阔处，潮流虽仍属往复流，但已略呈旋转性。港区水域西部流速大于东部，大、中潮期间落潮流流速大于涨潮流流速（小潮期间相反），流速一般随深度增大而减小。洋山港区主航道疏浚段涨潮平均流速0.9节～2.6节，流向258°～289°，其中主要分布在270°～289°。落潮平均流速0.9节～2.6节，流向085°～110°，其中主要分布在90°～110°。洋山港区主航道疏浚段涨潮流流速最大为4.8节，流向288°，落潮流速最大为5.4节，流向102°。
东海大桥附近水域，潮流运动的形式基本为往复流。芦潮港至小乌龟岛海域多年实测涨落潮流大致相当，最大涨潮流流速3.6节～4.5节，流向252°～284°；最大落潮流流速3.9节～4.7节，流同089°～119°。
风上海港全年多为东南风，西北及东北风次之，强风向为东北风。风的季节性变化明显，春、夏两季和初秋多南东南风和东南风，晚秋和冬季多北西北风和北东北风。
长江口附近水域风向季节变化明显，平均持续时间最长的风向为东南－南东南。风力≥6级的主要风向（即强风向），春季和夏季为南东南，秋季为北东北－东北，冬季为西北－北西北。
长江口附近大风日数较多，持续时间长，且风速大。陆地大风日数则较少，持续时间短，且风速小。每年10月至次年2月是全年冷空气最多的时期，每次冷空气过境就会出现一次大风，风向多为北到西北风。3月－6月是低压和冷空气交替时期，风向多偏南，长江口附近的低压大风有时来得很突然。7月－9月是台风和雷暴大风时期，也是全年风速最大的时期，雷暴大风往往来得很急。
热带气旋（热带低压、热带风暴、强热带风暴、台风）所带来的狂风、暴雨、风暴潮是严重影响上海的灾害性天气。1949年－2001年影响上海市的热带气旋（过程雨量≥50毫米，平均风速≥7级或同时过程雨量≥30毫米和平均风速≥6级）总次数为156次，年平均2.94次，其中影响严重的热带气旋（过程雨量≥200毫米，平均风速≥9级或同时过程雨量≥100毫米和平均风速≥8级）总次数为44次，占了28.2％，年平均0.83次。影响上海的热带气旋最多的年份达7次（1990年），影响严重的热带气旋最多的年份达3次（1960年，1989年，1994年）。影响上海的热带气旋最早出现在5月，最迟在11月，其中以7月－9月最为集中，约占全年的86％，8月为全年之最，9月次之。影响严重的热带气旋主要出现在6月－10月，其月份分布特征与影响台风类同。影响上海的热带气旋大多达到台风强度，占总数的76％。影响上海的台风因强度、路径、移速不同，持续时间长短也不一，平均为2天～3天，最长7天最短1天。台风最大风力达12级以上，最大风速43.9米／秒。
据资料统计，台风中心移到离上海海岸线东南约12海里时，海岸带一般可出现6级以上的大风，如其中心在海岸线以东5海里时，则海岸带可出现8级以上大风。由于地理环境的不同，台风带来的大风的地理分布有很大差异，海区受台风影响时出现的风力比市区、内陆大1级～2级，8级及以上大风多50％以上。如1997年8月18日－19日影响上海的11号台风（在浙江温岭登陆），极大风速达34米／秒，南汇大治河河口滩涂的最大风速达23.8米／秒，离海岸线10余千米的川沙、南汇气象站的最大风速分别为19米／秒和16米／秒。
台风大风的最多风向是东北偏北向，其次是东南向。
上海地区每年3月－10月间局部地区可能出现龙卷风，主要出现在7、8月，其次是6、9月，其他月份很少。着地龙卷风平均每年2次，最多4次。出现时间多在下午到傍晚，其持续时间常常只有十几分钟，影响范围小，破坏性大，常夹带冰雹和阵雨。
雾长江口及附近的雾主要为平流雾和锋面雾，各月雾日不等，3月－5月较多，其中4月最多，2月和6月次之，8月几乎无雾。年平均雾日28.1天，最多年份40天，最少年份17天。雾的持续时间也不等，4月和5月曾出现过连续8天的雾。2月－4月于潮水初涨后常产生浓雾，秋、冬季也常受陆地漂来的辐射雾的影响，往往使船舶不能及时进出港。
黄浦江的雾主要为辐射雾和平流雾。
航行条件助航标志山和大戢山四个设有灯塔的岛礁，是船舶从外海识别和接近上海港的良好目标；崎岖列岛的大洋山、小洋山是船舶识别和驶往洋山港区的重要导航目标。
长江上海段：
长江口附近建有DGPS基准台，船舶在该水域可收到蒿枝港DGPS、大戰山DGPS基准台发布的全球卫星定位差分信息，提供精度在5米以内的定位功能。
目前，上海海事局建立了能覆盖整个长江上海段的船舶自动识别系统(AIS)的基站网络，分别建有：横沙、鸡骨礁、花鸟山、大戰山和吴淞AIS基站，中心设在上海浦东东塘路150号的上海航标处。该网络与江苏段五站一辖区中心和东海沿海AIS骨干岸基网络系统相连。长江口航标遥测遥控系统向装有AIS船载设备的船舶发布助航、航行管理信息。
佘山岛，位于长江口外、崇明浅滩东南部，为一个半圆形孤岛。长约0.5千米，宽约0.2千米，岛顶较平，面积约0.1平方千米，岸线均系陡峻的岩岸。岛东部设有灯塔，配有AIS，灯高70米，是北来船舶接近长江口的重要导航目标，但夜晚岛上灯光较多须正确辨认。该岛海域南、北水较浅，其周围均为稀泥底。
鸡骨礁，位于佘山岛东南方16.5海里处，是一群上海港附近的佘山岛、鸡骨礁、花鸟礁石，其东侧一礁为主礁，长仅26米，宽约19米积约500平方米，高12.2米。其上建有建筑物禾塔，设有船舶自动识别系统(AIS)基站，从东北方去像一艘商船，在雷达荧光屏上显示也近似于万级船舶。
花鸟山，位于鸡骨礁东南方25海里处，是马列岛北端的一个岛屿，岛高236米。岛顶有两个峰，从南、北方向望去呈马鞍形，非常显著。岛东有一孤立白礁，局部呈白色，极易辨认。岛上设有舶自动识别系统(AIS)基站，岛北角上设有灯塔高89米。
大戢山，位于花鸟山西偏南方约26海里处上长满树木，从东北方向望去呈圆锥形。岛上设有船舶自动识别系统(AIS)基站，岛顶设有灯塔，灯高92米。
上海海事局为保证《长江上海段船舶定线制路调整方案》的有效实施，对长江上海段水域各主航道航标重新进行了调整，加大了航标布设密度，统一了编号。航行于长江上海段的船舶应严格遵守《长江上海段船舶定线制航路调整方案》，依照航标指示的通航分道航行。
长江口灯船，位于鸡骨礁东南方约9海里处，红色船身，两侧写有“长江口”字，船上铁柱装一灯，部置有浪动雾钟，是长江口船舶定线制A警戒区出长江口深水航道的重要助航标志，灯船上设AIS和雷达应答器。
南槽灯船，位于鸡骨礁东南方约13.4海里处，色船身，两侧写有“南槽”字，船上铁柱装一灯，尾部置有浪动雾钟，是长江口船舶定线制B警戒区进长江口南槽航道的重要助航标志，灯船上设有A和雷达应答器。
南支灯船，位于大戢山北方约10.6海里处，红船身，两侧写有“南支”字，船上铁柱装一灯，尾部有浪动雾钟，是船舶在长江口南支航道航行的重助航标志，灯船上设有AIS和雷达应答器横沙灯塔，位于横沙岛南端，白色四角柱形混土塔身，灯高57米，并设有船舶自动识别系(AIS)基站，是船舶进出长江口深水航道的重要目航标志。
九段灯船，位于南槽航道下段和南支航道交处，红色船身，两侧写有“九段”字，船上铁柱装一灯尾部置有浪动雾钟，是船舶进出九段沙警戒区的重要助航标志，灯船上设有AIS和雷达应答器。
圆圆沙灯船，位于圆圆沙航槽和南槽航道上昌的交汇处，红色船身，两侧写有“圆圆沙”字，船上铁柱装一灯，尾部置有浪动雾钟，是船舶进出圆圆沙警或区的重要助航标志，灯船上设有AIS和雷达应客器。
宝山大型灯浮，位于宝山北航道与宝山南航道上游的交汇处，红色标身，写有“宝山”字，是船舶进出浏河口警戒区的重要助航标志，灯浮上设有AIS和雷达应答器。
长江口的灯浮在强风过境后可能有灯光失常、毫灭或移位、漂失等现象。因此，船舶进出港口时应十分注意。
黄浦江水域：
上海港在黄浦江水域的吴淞、陆家嘴等处分别建有吴淞、杨树浦、陆家嘴、龙华、闸港船舶自动识别系统(AIS)基站，为进出黄浦江水域的船舶导航。
吴淞口灯塔，位于吴淞口防沙堤的端部，白色圆主形混凝土塔身，灯高17米，并设有雷达应答器和AIS，是船舶进出黄浦江的重要助航标志。
吴淞口引导灯桩，位于吴淞口灯塔西南约9链的岸上，标身为白色方形铁架，两灯一线方位250°20′20″，是引导船舶进黄浦江的重要助航标志。
随着上海港多年的建设与发展，黄浦江水域两岸码头林立，船舶通航密度非常大，为保障航行安全汤通，上海港在黄浦江航道和沿岸设置了大量灯浮、灯桩等人工助航标志，保证了船舶昼夜进出的安全。
黄浦江两岸的灯桩一般都设在弯道水域的岸上，引导船舶航行和转向。
龙华港灯桩，位于龙华港与黄浦江交汇处南岸端部的信号台上，并建有自动识别系统(AIS)基站，灯桩为镀锌钢管标身，矩形霓虹灯，为船舶航行龙华弯道水域的重要助航标志。
黄浦江两岸码头密集，高大显著建筑物众多，均可作为船舶导航目标。如：东方明珠电视塔就是陆家嘴弯道水域最显著的目标。此外，沿岸的享誉世界的环球金融中心、金茂大厦等著名建筑以及各弯道水域处的信号台、瞭望台等建筑物也是船舶航行的良好导航标志。
杭州湾北岸：
上海港在芦潮港和金山咀西南约1.8海里近岸，分别设有船舶自动识别系统(AIS)基站，为进出临港新城港区以及金山和漕泾化工港区的船舶导航。
西马鞍山岛，位于南汇嘴南东南约21海里处，岛呈马鞍形，东部山峰上设有灯塔，白色圆柱形混凝土塔身，灯高99米，设有雷达应答器，是船舶由长江口往杭州湾和进出洋山港区的重要导航目标。
漕泾大型灯浮，位于西马鞍山岛西西南约5海港上海里处，红色圆柱形，直径5米，上写“漕泾”字，并配置有雷达应答器。该大型灯浮位于漕泾东航道与金山航道的交汇处，目标显著易识。
唐脑山，位于西马鞍山岛西西北约9.2海里处，岛形狭长，呈西北一东南走向，上设灯塔，白色圆柱形混凝土塔身，瓷砖贴面，配置有雷达应答器，为船舶进出漕泾东航道的重要导航目标。
对口山，位于唐脑山西南方约14海里处，上设灯桩，白色圆柱形混凝土桩身并配置有雷达应答器，是船舶在金山航道航行及转向的重要导航目标。
滩浒山，位于唐脑山西方约18海里处，上设灯桩，白色圆柱形混凝土桩身，是船舶在漕泾东航道航行的良好导航目标。
王盘山，位于滩浒山西南方约11海里处，由5个小岛组成，东部的下盘山是最大的一个岛，岛上设有灯桩，红白横带圆塔形玻璃钢桩身并配置有雷达应答器，是船舶在金山航道航行的重要导航目标。
大金山岛(105)，位于滩浒山西北方约11.5海里处，北侧陡峭，上设灯桩，红白相间横带圆柱形不锈钢桩身，为船舶在漕泾西航道与漕泾东西航道通道转向的重要导航目标。
此外，上海港在漕泾东、西航道设有灯浮指示，在金山港区和漕泾化工港区码头前沿设有灯桩，保障船舶进出航道的安全。
洋山港区：
上海港在大戰山和小衢山分别建有船舶自动识别系统(AIS)基站，为进出洋山港区的船舶导航。
大戢山，位于花鸟山西偏南方约26海里处，岛上长满树木，从东北方向望去呈圆锥形。岛上设有船舶自动识别系统(AIS)基站，岛顶设有灯塔，灯高92米，为由北方接近洋山港船舶的重要导航目标。
大洋山，位于南汇嘴南东南约18海里处的大洋山东部，为崎岖列岛的主岛，主峰位于岛的南部，高204米，顶部有一塔形建筑物，是船舶识别洋山深水港的良好目标。
公山灯塔，位于大洋山的东部，设在雷达站铁塔的平台上，并设有AIS，其北方端部的公山角上还设有公山角灯桩，是船舶识进出洋山港主航道的重要导航目标。
黄泽洋灯船，位于30°30′.2N、122°32′.8E处，红色船身，两侧写有“黄泽洋”字，船上铁柱装一灯，尾部置有浪动雾钟，并设有AIS和雷达应答器，是船舶进洋山港主航道的重要助航标志。
黄泽山，位于大洋山东南约14海里处，顶峰位于岛中部的黄泽山，高156米，岛东北端部设有灯桩，位于洋山港主航道南侧，是船舶在洋山港主航道航行的重要助航标志。
小衢山，位于黄泽山西方，顶峰位于岛中部的红毛岗墩，高203米，其北部设有灯塔，并设有船舶自动识别系统(AIS)基站，是船舶在洋山港主航道航行的重要助航标志。
薄刀嘴岛，位于小洋山(141)的顶峰观音山东东南方约4.3海里处。其东端陡直，上设灯桩，从西北方望去显著易认。
西马鞍山岛，位于大洋山东南方约3.8海里处，岛呈马鞍形，东部山峰上设有灯塔，白色圆柱形混凝土塔身，灯高99米，设有雷达应答器，是船舶进出洋山港的重要导航标志虎啸蛇岛，位于西马鞍山岛东北方约2海里处，岛西南岸设有灯桩，该灯桩与西马鞍山岛灯塔分别位于洋山港主航道两侧，是船舶在洋山港主航道航行的重要助航标志。
筲箕岛，位于虎啸蛇岛西北方约1.3海里处，岛南岸设有灯桩，位于洋山港主航道东北侧，是船舶进出洋山深水港的良好助航标志。
外后门岛，位于西马鞍山岛西北方约2.5海里处，岛西北岸设有灯桩，位于洋山港主航道西南侧，是船舶进出洋山深水港的重要助航标志。
此外，在洋山深水港进港航道还设有Y0号一Y12号灯浮，部分灯浮还设有AIS，同时还设有6个AIS虚拟航标，为进出洋山港主航道的船舶导航。
东海大桥各通航孔水域均设有“B”字号左右标，引导船舶通过桥区。
航行障碍物上海港水域的主要航行障碍物是长江口附近的拦江沙、沉船，而外海的洋山港区水深开阔，航行障碍物较少。
长江上海段：
长江上海段航行障碍物主要是拦江沙，其次是沉船。拦江沙由长江水流夹带的泥沙淤积而成，经常变迁。现长江口深水航道南、北导堤的建成，航道基本不受淤积影响。
避航区，铜沙沙咀附近水域的沉船、航行障碍物较多，上海海事局规定其周边水域为避航区，其范围为南汇嘴、禁0号一禁16号灯浮、大治河东口南端依次连线范围内水域，航经附近水域的船舶应避免驶入该区域。
横沙岛西北端、长兴岛南咀受风浪侵蚀，经常倒塌变迁，因此岛岸附近筑有许多石坝。横沙岛西南岸和长兴岛东北岸的沙滩不断向外延伸，高潮时淹没。
九段沙东南浅滩嘴变迁较大，船舶于南槽航道航行时应注意。
拋泥区，鸡骨礁南西南方、长江口深水航道北框航道南导堤东南方约5.5海里处，长江口深水航道与南槽水道下段之间，H1、H2号灯浮的连线以南长乡3.2海里、宽约8链的长方形水域，设有3号倾倒区3号倾倒区西北约8海里、长江口深水航道北槽舰航道南导堤东北侧平行于南导堤，有长约2.2海里宽约3链的长方形水域，设有2号倾倒区，其西北立设有H20号灯浮。
在长江口深水航道北槽航道两侧的南、北导七内侧分别建有多处向长江口深水航道北槽航道延仆的丁坝，坝端设有灯桩。南、北导堤及丁坝堤顶标在理论最低潮面上0.2米~2.3米，低潮时露出水面黄浦江水域：
黄浦江水道自然条件良好，水深、底宽大，经上海港多年对河道的维护，主航道无礁石、浅滩等行障碍物。但黄浦江属自然航道，曲折多弯，有吴口、张华浜、高桥、陆家嘴、董家渡、鳗鲤咀等多处道，转向弯度大。由于水流的冲刷作用，一般弯道四岸一侧是深水航道，对岸是浅水区。航道最宽处-般都在深水航道与浅水航道汇合处，江面也较宽，仙水深较浅。
吴淞口水深变化大，船舶航行须注意。
吴淞口水域自北港嘴至仓房港之间黄浦江东有大片沙滩向岸外延伸约1链，沙滩外侧为水深于5米的浅水区，该段水域深水主航道略靠向黄江西岸，出港船舶注意控制船位新开港至上海制盐厂码头之间，即107号108号灯浮之间进港主航道南边缘，有一片水深小于5米的浅水区向主航道延伸，进港船舶航行应注意。
上海制盐厂码头至上粮五库码头之间，黄浦江进港主航道南及西南侧水域，有大片水深小于5米的浅水区，进港船舶注意控制船位。
复兴岛中华造船厂码头东方，B4至B8号系舟浮筒之间进港主航道西边缘，分别有水深4.7米、4.9米、4.8米三处浅点，进港船舶应注意。
复兴岛东南岸向西南过杨浦大桥至杨浦自来z厂南岸附近有大片水深小于5米的浅水区位于主舟道西北侧，进港船舶应注意不要靠近进港主航道西北侧航行。
卢浦大桥上游至龙华咀之间出港主航道南及东南边缘，水深小于5米的浅水区靠近主航道，出港舟舶航经该弯道水域时注意控制船位。
杭州湾北岸：
杭州湾水域开阔，海底平坦，海区较干净，航行障碍物少，但在一些海域鱼汛期渔网、渔栅较多，船舶航行须注意。
西马鞍山岛灯塔南偏东3海里处，有一木质概位沉船(2004)靠近金山航道。
西马鞍山岛灯塔西偏北约3.2海里处，有其上水深仅2.5米的灰泥暗礁，位置危险孤立，设有AIS虚拟孤立危险物标指示，航经附近水域船舶应注意。
唐脑山灯塔西南约3.2海里处，有一扫测水深6.4米的沉船(2008)位于漕泾东航道东南边界附近，船舶航行应注意。
唐脑山灯塔西南约6海里处，有一扫测水深6.4米的沉船(2002)位于金山航道南边界内侧，船舶航行应注意。
在大金山岛灯桩东南约8链处、浮山岛东方，有一水深4.6米的危险浅点，靠近漕泾西航道西南边界，船舶航行应注意。
洋山港区：
洋山深水港位于距大陆较远的外海，港区四周水域开阔、水深，特别是新开辟的洋山港主航道，基本无航行障碍物。
黄泽山东北端外侧有急流。
大戰山南西南方约3海里处，有一概位危险沉船(1998)靠近洋山港东支航道入口据报在小洋山西方2.8海里处，有一露出沉船(1960)。
虎啸蛇岛西南端南方约1链处，有一干出2米的蛇蛋礁接近洋山港主航道的东北侧，船舶航行应注意。
崎岖列岛附近鱼汛期间，捕捞作业繁忙，渔船众多，海域内多临时渔栅。
架空电线黄浦江水域，在吴淞、吴泾、闵行三处分别建有架空电线，通过三处架空电线水域的船舶应注意限高：
船舶航经吴淞架空高压电线时，其水面以上最大高度加上通过高压电线时的当地潮高不得超过70.99米(海图标注限高65米)。
船舶航经吴泾架空高压电线时，其水面以上最大高度加上通过高压电线时的当地潮高不得超过39.8米(海图标注高于该限高，以此限高为准)。
船舶航经闵行架空高压电线时，其水面以上最大高度加上通过高压电线时的当地潮高不得超过28.0米(海图标注高于该限高，以此限高为准)。
桥梁―上海港黄浦江水域建有7座大桥，分别港上海为杨浦大桥、南浦大桥、卢浦大桥、徐浦大桥、闵浦大桥、奉浦大桥和闵浦二桥。欲通过大桥水域的船舶应注意上海海事局公布的《上海海事局桥区水域通航安全监督管理办法》对通过大桥水域船舶的限制规定：
通过南浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的黄浦公园潮位应低于48米(海图标注限高44米)。
通过卢浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的黄浦公园潮位应低于48米(海图标注限高46米)。
通过杨浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的高桥潮位应低于52米(海图标注限高48米)。
通过徐浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的黄浦公园潮位应低于47米(海图标注限高44米)。
通过闵浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的当地潮位应小于41.8米(海图标注限高39米)。
通过奉浦大桥的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的当地潮位应低于29.5米(海图标注限高22米)。
通过闵浦二桥通航孔(主桥墩南侧)的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的当地潮位应低于28米(海图标注限高28米)。
黄浦江各跨江大桥的桥区(安全)水域范围为桥梁轴线两侧90米之内水域。船舶航经奉浦大桥、闵浦二桥的船舶，还应当遵守各通航孔的通航要求：
(一)奉浦大桥
1.水面以上最大高度22米及以下的小型船舶上驶时，应当从北孔通过；当中孔无大型船舶行驶时，可视情况从中孔通过。
2.水面以上最大高度22米及以下的小型船舶下驶时，应当从南孔通过。
3.大型船舶(船队)应当通过中孔航行。
(二)闵浦二桥
1.船舶(船队)应当通过通航孔(主桥墩南侧)航行。
2.闵浦二桥北侧桥孔禁止船舶航行。
轮渡黄浦江主要过江轮渡线10余条，早晨和傍晚是轮渡过江高峰时间，一条轮渡线上往往有4艘渡轮穿梭往来。船舶在江中航行时，应密切注意渡轮动向，谨慎驾驶，避免拦头或抢档，以策安全。
详细情况见过江轮渡表。
航道进出上海港各水域航道主要有长江口水航道、黄浦江航道、金山航道及洋山港区主航道。航行长江口和黄浦江水域船舶必须遵守《长江上海段船舶定线制航路调整方案》、《上海黄浦江通航安全管理规定》、《上海洋山深水港区及其附近水域通航安全管理规定》等相关规定。
长江上海段：
长江上海段水域有多条进出港航道，由于水深宽度等条件不同，航道功能有所不同，分为主航道辅助航道和小型船舶航道三类。主航道包括长江口深水航道、外高桥航道、宝山航道、宝山北航道和宝山南航道。辅助航道包括南槽航道下段和南槽航道上段。小型船舶航道包括南支航道延伸段、南支航道、圆圆沙北侧通道、外高桥沿岸航道、宝山支航道和宝山南航道南侧航道。
一、长江上海段主航道：1.长江口深水航道是目前进出黄浦江及长江沿岸各港区的深水航道，分为长江口深水航道北槽航道和长江口深水航道延伸段两部分。(1)长江口深水航道北槽航道属长江上海段主航道之一。船舶、设施在北槽航道及其南北两侧可航水域航行、停泊、作业及其他相关活动应遵守《长江口深水航道(12.5米)试通航期间通航安全管理办法》。北槽航道东起长江口A警戒区西侧边界线，西至圆圆沙警戒区的东侧边界线为止，航程约43海里。A警戒区西侧边界线至D12号灯浮航道底宽400米，设标宽550米；自D12号灯浮至圆圆沙警戒区东侧边界线航道底宽为350米，设标宽500米。北槽航道底宽维护水深为理论最低潮面以下12.5米。北槽航道边界线由侧面标标示，其航道中心线为通航分道分隔线。北边界线为地理坐标A(31°06′17″.2N、122°29′41″.7E)，D3号至D45号奇数号灯浮的依次连线向航道中心线平移75米之平行线至地理坐标点H1(31°19′15″.3N、121°43′29″.3E)的依次连线；南边界线为地理坐标B(31°06′04″.1N、122°29′41″.7E)、D4、D6、D8号灯浮、D10AIS虚拟航标，D12号至D42号偶数号灯浮的依次连线向航道中心线平移75米之平行线至地理坐标J1(31°19′08″.6N、121°43′13″.9E)的依次连线。北槽航道主要供客运班轮和实际吃水7米及以上船舶双向通航。(2)长江口深水航道延伸段位于外高桥航道、宝山航道和宝山北航道中，并穿越圆圆沙警戒区、吴淞口警戒区、宝山警戒区和浏河口警戒区。船舶、设施在深水航道延伸段及其南北两侧可航水域航行、停泊、作业及其他相关活动应遵守《长江口深水航道(12.5米)延伸段试通航暂行规定》。
深水航道延伸段东起圆圆沙警戒区东侧边界线与北槽航道相接，西至浏河口上海港界线为止。深水航道延伸段边界线由地理坐标和AIS虚拟航标标示，地理坐标I1(31°19′11″.9N、121°43′21″.6E)至地理坐标I8(31°32′49″.6N、121°19′59″.3E)的依次连线通航分道分隔线，将外高桥航道、宝山航道和宝山北航道分隔成进出口通航分道。北边界线为地理坐标H1(31°19′15″.3N、121°43′29″.3E)，“SHENSHUIBEIJIE1”号(31°19′30″.2N、121°42′48″.7E)至“SHENSHUIBEIJIE14”号(31°32′54″.9N、121°20′02″.2E)AIS虚拟航标的依次连线；南边界线：地理坐标J1(31°19′08″.6N、121°43′13″.9E)“SHENSHUINANJIE1”号(31°19′20″.0N、121°42′42″.8E)AIS虚拟航标、地理坐标J2(31°20′16″.0N、121°40′48″.4E)，“SHENSHUNANJIE2”号(31°20′20″.5N、121°40′39″.0E)至“SHENSHUINANJIE14”号(31°32′44″.3N、121°19′56″.4E)AIS虚拟航标的依次连线。深水航道延伸段底宽自地理坐标I1(31°19′11″.9N、121°43′21″.6E)至地理坐标I3(31°22′31″.0N、121°36′26″.4E)间底宽为350米；地理坐标I3至地理坐标I4(31°23′16″.7N、121°34′50″.3E)间底宽由350米逐渐增至460米；地理坐标I4至地理坐标I6(31°28′10″.4N、121°27′17″.7E)间底宽为460米；地理坐标I6至地理坐标I7(31°29′47″.6N、121°25′37″.3E)间底宽由460米逐渐减至350米；地理坐标I7至地理坐标I8(31°32′49″.6N、121°19′59″.3E)间底宽为350米。深水航道
延伸段主要供客运班轮和实际吃水7米及以上船舶双向通航。
2.外高桥航道，东起圆圆沙警戒区西侧边界线，西至吴淞口警戒区东侧边界线为止，航程约6海里，航道宽度约1150米。深水航道延伸段位于外高桥航道中，航道中心线为通航分道分隔线，并将外高桥航道分隔成进出口复式通航分道。北边界线为47号、49号、51号、53号灯浮和地理坐标G(31°23′30″.8N、121°34′59″.7E)的依次连线；南边界线为A54A号、A54B号、A56号、A58号和A60号灯浮的依次连线。外高桥航道主要供大型船舶和小型船舶双向通航。客运班轮和实际吃水7米及以上船舶可在设置于外高桥航道中的深水航道延伸段内航行，但不应妨碍在深水航道延伸段内正常航行的限于吃水船舶。实际吃水小于7米的船舶应当在设置于外高桥航道中的深水航道延伸段外侧的该通航分道内航行；小型船舶只要安全可行，应当在通航分道内尽可能靠右航行。
3.宝山航道，东起吴淞口警戒区西侧边界线，西至宝山警戒区东侧边界线为止，航程约3.5海里，航上海港道宽度1000米。深水航道延伸段位于宝山航道中，航道中心线为通航分道分隔线，并将宝山航道分隔成进出口复式通航分道。北边界线为67号、69号、71号灯浮和地理坐标&2(31°27′31″.3N、121°28′23″.1E)的依次连线；南边界线为66号、68号、70号、72号灯浮和地理坐标S(31°27′06″.7N、121°27′36″.9E)的依次连线。
宝山航道供大型船舶和小型船舶双向通航。客运班轮和实际吃水7米及以上船舶可在设置于宝山航道中的深水航道延伸段内航行，但不应妨碍在深水航道延伸段内正常航行的限于吃水船舶。实际吃水小于7米的船舶应当在设置于宝山航道中的深水航道延伸段外侧的该通航分道内航行；小型船舶只要安全可行，应当在通航分道内尽可能靠右航行。宝山航道内设有引航交接区。
4.宝山北航道，东起宝山警戒区西侧边界线，西至浏河口警戒区东侧边界线为止，航程约6.6海里，航道宽度1000米。深水航道延伸段位于宝山北航道中，航道中心线为通航分道分隔线，并将宝山北航道分隔成进出口复式通航分道。北边界线为75号、77号、79号、81号、83号和85号灯浮的依次连线；南边界线为74号、78号、80号、82号灯浮和宝山灯浮的依次连线。宝山北航道供大型船舶和小型船舶双向通航。客运班轮和实际吃水7米及以上船舶可在设置于宝山北航道中的深水航道延伸段内航行，但不应妨碍在深水航道延伸段内正常航行的限于吃水船舶。实际吃水小于7米的船舶应当在设置于宝山北航道中的深水航道延伸段外侧的该通航分道内航行；小型船舶只要安全可行，应当在通航分道内尽可能靠右航行。
5.宝山南航道，位于宝山北航道的南侧，东起宝山警戒区西侧边界，西至浏河口警戒区东侧边界，航程约6.5海里，航道最窄处为450米。北边界线为74号、A77号、A79号、A81号、A83号灯浮和宝山灯浮的依次连线；南边界线为距宝山南航道南侧航道南边界线100米的北侧平行线，并与宝山警戒区西侧边界线相交于地理坐标&3(31°27′42″.6N、121°26′40″.9E)，及与浏河口警戒区东侧边界线相交于地理坐标W3(31°31′32″.9N、121°20′48″.5E)。宝山南航道供下行大型船舶和从下游水域上行靠泊罗泾、宝钢等沿岸码头的船舶航行。
二、长江上海段辅助航道：1.南槽航道下段，南槽航道下段东起长江口B警戒区西侧边界线，西至九段沙警戒区的东侧边界线为止，航程约26.4海里。南槽航道下段由安全水域标标示航道走向，安全水域标的依次连线为通航分道分隔线。北边界线为以地理坐标K(30°59′59″.4N、122°29′41″.7E)，SO号灯浮至S7号灯浮的依次连线为基线，距其0.5海里的北侧平行线，及以S7号灯浮至S16号灯浮的依次连线为基线，距其500米的北侧平行线，经A25号灯浮，并延伸至A27号灯浮；南边界线为以地理坐标K，S0号至S7号灯浮的依次连线为基线，距其0.5海里的南侧平行线，及以S7号至S16号灯浮的依次连线为基线，距其500米的南侧平行线延伸至九段灯船。南槽航道下段可供大型船舶和小型船舶双向通航。
2.南槽航道上段，南槽航道上段东起九段沙警戒区西侧边界线，西至圆圆沙警戒区的东侧边界线为止，航程约18.7海里。南槽航道上段边界线由侧面标标示，航道的中心线为通航分隔线。北边界线为A29号至A53号奇数号灯浮，圆圆沙灯船的依次连线；南边界线为A28号至A54号偶数号灯浮的依次连线。南槽航道上段可供大型船舶和小型船舶双向通航。
三、长江上海段小型船舶航道：1.南支航道延伸段，南支航道延伸段北起长江口南支灯船，南至A0号灯浮为止，航程约11海里。南支航道延伸段由安全水域标标示航道走向，安全水域标的依次连线为通航分道分隔线。东侧边界线为以A0号至A9号灯浮，南支灯船的依次连线为基线，距其500米的东侧平行线；西侧边界线为以A0号至A9号灯浮，南支灯船的依次连线为基线，距其500米的西侧平行线。南支航道延伸段主要供小型船舶双向通航。
2.南支航道，南支航道位于南槽航道下段的南侧，东起长江口南支灯船，西至九段灯船为止，航程约11.2海里，航道宽度1000米。南支航道由安全水域标标示航道走向，安全水域标的依次连线为通航分道分隔线。北边界线为以南支灯船，A10号至A15号、A17号、A19号、A21号、A23号灯浮的依次连线为基线，距其500米的北侧平行线并延伸至九段灯船；南边界线为以南支灯船，A10号至A15号、A17号、A19号、A21号、A23号灯浮的依次连线为基线，距其500米的南侧平行线并延伸至A26号灯浮。南支航道主要供小型船舶双向通航。
3.圆圆沙北侧通道，圆圆沙北侧通道位于北槽航道圆圆沙段的北侧，航程约1.5海里，航道宽度200米。北边界线为距地理坐标Y(31°18′40″.3N、121°45′15″.0E)和D43号AIS虚拟航标连线200米的北侧平行线延伸至地理坐标T点(31°19′20″.5N、121°43′41″.3E)。南边界线为地理坐标Y、D43和D45号AIS虚拟航标的依次连线。圆圆沙北侧道主要供进出横沙通道的小型船舶双向通航4.外高桥沿岸航道，外高桥沿岸航道位于外桥航道的南侧，航程约6海里，航道宽度550米750米。北边界线为A54A号、A54B号、A56号A58号和A60号灯浮的依次连线；南边界线为地坐标L(31°19′43″.3N、121°40′22″.0E)、地理坐标(31°19′50″.4N、121°40′10″.9E)，沿距外高桥沿岸码头沿100米的北侧平行线延伸至地理坐标(31°22′41″.9N、121°34′26″.9E)。外高桥沿岸航道主要供下行小型船舶航行。
5.宝山支航道，宝山支航道位于宝山航道的侧，航程约4海里，航道最窄处宽度430米。北边线为66号、A73号、A75号、70号、72号灯浮和地理标S(31°27′06″.7N、121°27′36″.9E)的依次连线；南界线为A72号AIS虚拟航标，沿距吴淞口国际邮车码头前沿100米的北侧平行线，连接地理坐标(31°25′08″.6N、121°29′10″.1E)、地理坐标Q(31°25′33″.3N、121°28′45″.3E)和A76号灯浮。宝山支航道主要供下行小型船舶航行。
6.宝山南航道南侧航道，宝山南航道南侧航道位于宝山南航道南侧，航程约6.5海里，航道宽肩100米。北边界线为距其南边界线100米的北侧平行线，并与宝山警戒区西侧边界线相交于地理坐标&3(31°27′42″.6N、121°26′40″.9E)，及与浏河口警戒区的东侧边界线相交于地理坐标W3(31°31′32″.9N、121°20′48″.5E)；南边界线为地理坐标&1(31°27′40″.5N、121°26′38″.1E)，沿距宝钢主原料码头前沿线100米的北侧平行线，经地理坐标R(31°28′59″.8N、121°24′32″.5E)，至罗泾码头前沿线100米的北侧平行线，连接A80号、A82号和A84号灯浮。宝山南航道南侧航道主要供下行小型船舶航行。
7.长兴水道，为长兴岛西南岸外可航深水航道，由于上海港打造长兴岛造船基地的发展目标，长兴岛西南岸相继建立了多家大型造船重装备企业，长兴水道也得到重点维护，水道内助航标志配置完善，在距岸400米~1100米的水深大于6米水域中设置有10座灯浮标，编号自301号一310号，灯浮间距约1海里。
8.北港水道，原称北水道或北港，介于崇明岛、崇明浅滩和长兴岛、横沙岛、横沙浅滩之间。该水道可通向东海，可航水域的水深5米~10米不等，北港上口通道演变复杂，下口又受拦门沙浅滩的影响，水深变化很不稳定，只有熟悉当地情况的船舶使用。
同时在长兴岛和崇明岛之间，建有上海长江大桥，设有灯浮标志指示，进出该水道的船舶应遵守《上海海事局桥区水域通航安全监督管理办法》中有关上海长江大桥的通航规定。
9.新桥通道与新桥水道，位于宝山航道至崇明鸟之间，设有202号灯浮一215号灯浮标志。其中，新桥通道自202号灯浮至206C号灯浮，新桥水道位于崇明岛的南岸，自207号灯浮至215号灯浮。
夏用新桥通道、新桥水道的船舶多数为往返于崇明马至上海的客、渡船以及小型货船。航行在该水道的船舶应注意船位，防止船舶偏离航道搁浅。
黄浦江水域：
根据上海海事局公布的《上海黄浦江通航安全管理规定》，将黄浦江航道划分为：主航道、辅航道和特殊航道，其中在吴泾段还划定有吴泾深水航道。
一、主航道：主航道为黄浦江水道中划分的供大型船舶进出的深水区域，供拖轮船队和500总吨及以上或船长50米及以上的船舶双向航行。主航道实行分道通航，主航道中心线为进、出口航道的分隔菱.主航道中心线浦西侧为进口航道，主航道中心线甫东侧为出口航道。
主航道浦西侧边界线：自吴淞口灯塔起，依次沿导堤外侧80米处和浦西各码头前沿80米、闸北电厂取水口外侧65米顺河道弯度经107号、108号、110号灯浮、S16号至S19号系船浮筒、地理坐标点A(31°18′30″N、121°33′21″E)、B1号至B37号系船手筒、地理坐标点B(31°13′59″N、121°29′29″E)的连戋：自B74号系船浮筒起，顺河道弯度沿原江南造暨厂码头前沿100米、开平码头(现终止装卸作业)面沿80米至轮渡临浦线浦西码头上游端外侧80米三连线；自轮渡临浦线浦西码头上游端起，以黄浦江两侧5米等深线为基线，该基线的中心线为主航道主、出口通航分道的分隔线，沿分隔线向浦西侧100米至131号灯浮并与吴泾深水航道浦西侧边界线晶连。
主航道浦东侧边界线：自黄浦江江界起沿101号灯浮顺河道弯度经103号至106号灯浮、B41号、342号、B43号系船浮筒至114号灯浮的连线；自14号灯浮起，顺河道弯度沿浦东侧各码头前沿80米(其中“江山”船坞前沿50米)经地理坐标点C31°11′15″N、121°28′03″E)、D(31°09′38″N、121°27′53″E)、E(31°09′31″N、121°27′50″E)至轮渡临浦线信东码头上游端外侧100米处的连线延伸至133号灯浮南侧100米处并与吴泾深水航道浦东侧边界线晶连。
港海上二、辅航道：辅航道由进口航道、出口航道组成，供500总吨以下或船长50米以下的船舶单向航行。
其中，进口航道为主航道浦西侧边界线至黄浦江浦西岸线之间的可航水域(不包括锚地)；出口航道为主航道浦东侧边界线至黄浦江浦东岸线之间的可航水域(不包括锚地)。
三、特殊航道：特殊航道为吴泾第二发电厂码头上游120米处至轮渡邬桥线之间，以5米等深线为两侧边界线的航道，供船舶双向航行。特殊航道实行分道通航，其航道中心线将其分隔为进口航道和出口航道。
四、吴泾深水航道：吴泾深水航道为黄浦江塘车线轮渡至吴泾第二发电厂码头，自131号灯浮向上游经133号灯浮至吴泾第二发电厂码头上游120米处总长4041米、底宽100米的人工疏浚航槽，航槽设计水深9.1米。该航道为限于吃水船舶的专用单程航道。使用该航道船舶吃水(d)为：d≤航道通航水深十吴泾潮高一富余水深，船舶应根据本船的装载实际情况选择合适的富余水深，但应保持不小于0.5米的富余水深。
杭州湾北岸：
一、金山航道，该航道自大戰山以东约6.7海里(Y24号灯浮)处向西南经崎岖列岛南方至杭州湾北
岸。其中，西马鞍山岛到陈山的金山航道于1975年为当时上海金山石化总厂运输原油而专门开辟，扫海航道宽度为2千米。往金山港区的金山航道下段，漕泾灯船至对口山之间航道轴向262°、对口山至下盘山之间为283°、下盘山至金山港区码头间为334°。该航道自东经121°25′至121°55′区域，航道水深小于8米。据资料载，最浅处在鸡娘礁南方3海里附近，水深为7.4米。过东经121°25′线后，航道水深超过8米，金山联检引航锚地至金山港区码头间航道水深在10米以上。
二、漕泾东航道，该航道为从大洋山南方至杭州湾北岸漕泾化工港区的航道，航道于大洋山西南约2.9海里的漕泾大型灯浮处与金山航道相连，航道扫海宽度1海里，航道水深在唐脑山灯塔以西，东经121°29′至121°37′之间存在水深小于7.5米的浅段，航道最小水深6.9米，漕泾化工港区码头附近水深在8米左右。注意该航道附近水域常有渔船和渔网，船舶应在灯浮指示的航道内航行。
漕泾东航道支线航道，该航道为连接漕泾东航道与金山航道及临港主航道的通道，扫海宽度约1.6海里，航道水深8米左右，设有灯浮指示，并配有AIS。
三、漕泾西航道，该航道经大金山岛与浮山岛的东侧和南侧，将漕泾东航道与金山航道连接，扫海宽度约1.1海里，是金山港区与漕泾化工港区之间的通道，航道设有灯浮标指示。大金山岛东侧，航道水深在8米左右。大金山岛南侧，航道水深在8米~10米。
四、临港主航道，该航道南端自漕泾东航道与漕泾东航道支线航道的交口向北至临港新城港区码头前沿，航道宽约1000米，长约13.6海里，双向航道，航道设计满足5000吨级杂货船全潮通航，兼顾2万吨级杂货船乘潮通航。
临港支航道，该航道东端与东海大桥二号通航孔连接，西端与临港主航道相连，航道宽约800米，长约4.2海里，双向航道，航道设计满足5000吨级杂货船航行。
洋山港区：
进出上海洋山深水港的航道有洋山港主航道和洋山港东支航道，大型集装箱船舶经上海洋山港主航道进出；小型船舶及自长江来的支线集装箱船舶通过洋山港东支航道进出一、洋山港主航道，位于川湖列岛南方，自黄泽洋灯船至洋山港区一期码头前沿，航道全长约26.4海里，设有灯浮指示，小衢山(203)东北约2.2海里处Y3号灯浮与Y4号灯浮连线以东至黄泽洋灯船为自然水深航道，航道宽为550米，双向通航；从Y3号灯浮与Y4号灯浮连线至东经122°10′.5经线之间为人工疏浚航道，航道底宽450米，疏浚水深16.5米，双向通航；自东经122°10′.5经线至洋山港区一期码头前沿，为水深大于20米的自然水深航道。
二、洋山港东支航道，航道自大戢山南偏西约2海里处至虎啸蛇岛东北约3海里与金山航道交汇，航道设有Y32号一Y36号安全水域标，其依次连线为航道中心线，中心线两侧各740米水域为通航分道。
三、东海大桥设置有4个通航孔，自南(小乌龟岛西北侧)向北依次为一号一四号通航孔，二号通航孔为主通航孔，其他为辅通航孔。
号通航孔，满足500载重吨散货船通航要求，为双孔单向航道，通航净空宽度2×56米，航经一号通航孔的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的当地潮位应低于17.5米。
二号通航孔，满足5000载重吨散货船通航要求，为单孔双向航道，通航净空宽度300米，航经二号通航孔的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥时的当地潮位应低于40米。
三号通航孔，满足1000载重吨散货船通航求，为双孔单向航道，通航净空宽度2×100米，航4三号通航孔的船舶，其水面以上最大高度加上过桥时的当地潮位应低于25米。
四号通航孔，满足500载重吨散货船通航要求为双孔单向航道，通航净空宽度2×56米，航经四号通航孔的船舶，其水面以上最大高度加上过大桥日的当地潮位应低于17.5米。
注：东海大桥通航孔净空高度起算点为当地历史最高潮位+4.02米(1985国家高程基准面)，富余高度为4米。
泊位序号泊位名称港区所属单位 结构形式 长度 水深 靠泊能力