第3关：暗黑支配者
背景介绍：世界各地都遭到了怪兽的袭击。人类面临着巨大的危机，大海兽加达诺索亚妄图摧毁一切。迪迦，你是世界的希望！打倒大海兽，拯救世界，拯救人类！
登场人物：迪迦奥特曼，大海兽加答诺索亚
胜利条件：击败大海兽加答诺索亚
失败条件：
1、时间到；
2、迪迦被击败；
3、石化的迪迦被拍碎。
隐藏条件：变成终极迪迦后发出终极赛贝利昂光线解决大海兽加答诺索亚。
S级条件：
1、体力残留50%以上；
2、时间残留1分30秒以上；
3、在未变成终极迪迦前用普通迪迦过关(单独成立)
攻略要点：
这关非常变态，需要很强的侧向移动技巧。战斗开始后，迪迦距离大海兽加答诺索亚很远，这时远距离牵制性光线会其很大作用！大海兽加答诺索亚速度慢，利用远距离光线使其眩晕槽增长，到一定量时迅速冲到它面前狠狠一击并配合赛贝利昂光线，然后等死。(你没看错，是等死)大海兽加答诺索亚会用贯穿光线打死迪迦。这时，Q版迷你游戏开始，玩家驾驶战机不断攻击大海兽加答诺索亚，吸引它注意从而保护石像。迷你游戏成功后，迪迦原地满血复活而且变身闪瞎眼的终极迪迦。这时重复之前的战术磨死它就好了，最好记得用光线！
至于S级的战术，与死前的战术差不多，各种调戏各种重复，憋屈死它。
注意：
大海兽加答诺索亚的必杀无法防御。而且只有死前发出过必杀技才会出现复活，否则直接失败。另外本关只能复活一次，就算24K氪金终极迪迦再中必杀也是直接秒。
迪迦新必杀技：迪迦计时器闪光。