它是一场噩梦,亦是社区传播研究的最好模型。
日本新冠疫情又创新纪录。
据日本共同社7月29日消息,该国单日新增确诊病例首次破千,多地刷新疫情暴发以来的单日新增纪录。至此,日本累计感染人数达33444人。
但这一数字不包括“钻石公主”号邮轮的712例确诊病例和13例死亡。
这艘被称为“海上病毒培养皿”的“恐怖邮轮”,于5月16日驶离日本横滨港。此后,有关这艘邮轮的医学研究陆续出炉。
最新消息称,“钻石公主”号的新冠病毒基因组序列显示:这被世界卫生组织单列为“其他”的聚集性感染事件,仅仅源于1名感染者。
“对乘客们来说,这是一场噩梦。对社区防疫而言,这艘船是最好的研究样本。”大流行病防疫和生物安全专家、美国约翰斯·霍普金斯大学卫生安全中心高级学者阿梅什·阿达利亚(Amesh Adalja)评论称,只要赋予其“完美的传播环境”,即使只有1个感染者、1个低传播力的病毒株,依然可以造成超级传播事件。
“恐怖邮轮”揭示三大传播特征2月1日,曾乘坐“钻石公主”号邮轮的一名80岁游客,被确诊新冠肺炎。
4天后,船长宣布整船隔离14天。期间,邮轮感染人数逐日递增,卫生和隔离措施屡遭质疑。豪华邮轮变成漂浮公海的“病毒监狱”。
2月6日前后,日本国立传染病研究所研究人员登船,配合进行检验检疫,并开展流行病学研究。
7月28日,研究所病原体基因组解析研究中心主任黑田诚于《美国科学院院报》(PNAS)发文称,2020年2月15日-17日,研究团队获得896人的咽拭子样本,包括880名乘客、15名船务人员和1名检疫人员。
分析结果揭示“钻石公主”号感染事件的三个特征。
第一,这是“一个人感染一艘船”的故事。
在896人中,共148个样本的实时定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)呈阳性,包括138名乘客、9名船务人员和1名检疫人员,阳性率达16.4%。
对这148个阳性样本进行基因测序,共确认70个基因组序列。将之与全球共享的3株病毒基因组序列进行比较,发现它们拥有同1个主要的非同义单核苷酸变异(SNV)。这意味着,所有阳性样本推测为同一感染源。
2月5日,“钻石公主”号开始14天的整船隔离。/AP第二,隔离有效,但疏散太晚。
研究人员建立数据模型反向计算,截至2月5日全船隔离时,船上新冠病毒基本传染数(R0)为2.28。2月7日,R0到达峰值。此后,病毒在船上继续传播,但途径变了,主要依赖于那些未经严格防护的工作人员(包括船务人员和登船检验检疫人员)。
黑田诚称,站在目前的时间节点回看,整船隔离显著减缓病毒传播速度,缩小疫情暴发规模,“让乘客们待在房间,确实有助于减少感染”。
但他亦承认,若是尽早撤离、疏散所有乘客和船务人员,可能总感染人数会进一步下降。
第三,爱社交的人,感染率高。
所有阳性样本广泛分布在全船18个区域。而结合确诊患者的行动轨迹分析,发现多数感染始于娱乐区,聚焦在爱跳舞、唱歌、购物和观看表演的人群中。
邮轮病毒传播存在两个波峰
此前,关于“钻石公主”号的研究发现,集中在传播率、传播途径等方面。
早在2月19日,日本国立传染病研究所就曾发布病例分析报告称,有33人于5日整船隔离前,已出现症状。6-9日,79名乘客和10名船员、总计89人发病。考虑到潜伏期,这说明,疫情在5日前明显已有一定程度的扩散。
该份报告指出,根据当时的确诊病例数和感染源追溯,病毒传播存在两个波峰。前期是乘客交叉传播,推测病毒经由派对、自助餐等人际交流进行传播。后期是工作人员带毒奔走,主要是船员提供服务而扩散。
图片来源于日本国立传染病研究所而在6月出版的《新兴传染病》(Emerging Infectious Diseases)上,日本国立传染病研究所、日本朝日综合医院(Asahi General Hospital)联合发文称,针对“钻石公主”号3711名乘客和船务人员的核酸结果显示,新冠病毒阳性率达19.2%。
其中,无症状感染者的比例非常高。在研究测试时,无症状感染者数量为410人,占确诊总数的57.6%。随后,维持无症状状态的人数为331人,占确诊总数的46.5%。转为有症状、需重症护理的,达40人,占确诊总数的5.6%。
论文通讯作者、日本国立传染病研究所合作研究员Takeshi Arashiro指出,邮轮采取“全员筛查”的标准,为发现轻症、无症状感染者,创造了机会。
“一系列研究说明,在适当情况下,新冠病毒等呼吸道病毒可以仅从一个人,就实现广泛传播。结合《美国科学院院报》的最新研究结果,我们需要将防控焦点,放在群体性活动中。这是邮轮业恢复运营时必须要考虑的重要因素。” 阿梅什·阿达利亚说。
隔离中的“钻石公主”号/AFP“恐怖邮轮”时间表
1月20日,“钻石公主”号从横滨港出发。船上约有3700人。
1月25日,一名80岁男性乘客下船。
2月1日,上述男性乘客被确诊为新冠肺炎。此后,其发病日期被确认为2020年1月23日。当时,他正在“钻石公主”号上。
2月3日,邮轮停靠在日本横滨港。
2月4日,日本卫生检疫官员登船,对船上首批31名已出现症状的乘客进行检测。
2月5日,首批被检测者中,10人新冠病毒核酸阳性。“钻石公主”号自当日起整船隔离两周,除确诊者需送医外,所有乘客和船员禁止登陆。
2月6日,疫情持续发酵,又有10人确诊;7日,确诊41例;8日,3例;9日,6例;10日,65例;12日,39例;13日,44例……
2月19日,乘客陆续下船。
2月21日,最后一批乘客下船。
2月22日,日本厚生劳动大臣加藤胜信承认失误。他透露,在已下船人员中,有23人自2月5日隔离开始后,从未接受过新冠病毒检测。
3月1日,加藤胜信表示,包括船长在内的全部船员都已下船。
3月15日,“钻石公主”号所有乘客和船务人员的检疫工作结束,累计确诊总数增至712例。
资料
1.Haplotype networks of SARS-CoV-2 infections in the Diamond Princess cruise ship outbreak. PNAS. First published July 28, 2020. doi.org/10.1073/pnas.2006824117
2.COVID-19 in 2 Persons with Mild Upper Respiratory Tract Symptoms on a Cruise Ship, Japan. Emerging Infectious Diseases. Volume 26, Number 6—June 2020
3.Diamond Princess’ coronavirus cases reveal pattern of disease. Bloomberg
医学界
作者:燕小六
审稿:田栋梁
校对:臧恒佳
原标题:《恐怖邮轮“钻石公主”号调查出炉:一个人“传染”一艘船》
阅读原文