在显微镜下快速观察后，实验室技术员或病理学家便可判断染色是否充分或过度。如果染色不充分，便需要在苏木精中再次浸染。如果染色浓度过强，切片显示背景染色，他们会使用酸性溶液淡化染色，实现切片染色的差异化。这一步骤后，需要再次使用蓝色染液并在自来水下冲洗。
下一步是伊红染色。伊红是苏木精的复染剂，可差异化地染出红细胞、胶原，并通过粉色展现出平滑肌。分化同样需要根据组织的情况用水洗去过量的伊红。然后将染色后的玻片浸入梯度乙醇中，再浸入二甲苯，对玻片脱水。完成染色和脱水后，使用封片剂来封装切片。
何时检查染色究竟是在苏木精染色后在显微镜下检查染色和分化，还是在伊红染色后，不同的方案做法也不同。在苏木精染色后检查，无论是再次浸染还是重复分化，都方便立即调整。在伊红染色后检查，可以让实验室技术员或病理学家对全染色玻片有一个更好的了解。
快速检查在实验室工作流中具有重要的作用，可以确保负责诊断的病理学家看到需要的细节信息。
可见结构使用明场照明可以观察H&E染色玻片。苏木精将细胞核染为蓝紫色，伊红将细胞质和结缔组织染为浅粉色。借助染色，病理学家可以轻松辨别不同的组织类型，例如肌肉或结缔组织，并发现切片中的畸形或不规则情况。这可以帮助它们识别反应特定的病理的变化，例如感染、慢性炎症或恶性肿瘤。借助可见信息，病理学家可以观察到组织内的结构变化，从而确定疾病的性质和进展。