地名由来：“三岔河”为满语撤叉河转音，含义为像辫子一样的长岗子。清朝末年只有少数人来此开荒占草，其中最早一家占荒户姓谢，因他家建在岗子上，故称“谢家岗子”。1901年，沙俄修筑东清铁路时，线路从谢家岗子东侧通过，并定车站。而站名则用勘测方案上的“三岔河”名（根据松花江与嫩江的汇合处的三岔河地名而定车站名称），后谢家岗子改为三岔河。
2005年10月，三岔河镇上榜第一届全国文明村镇名单。
扶余县三岔河镇始建于清朝乾隆年间，是吉林省北部的商埠重镇。三岔河镇介于长、哈两市之间，京哈铁路、国道102线和同三高速公路分别从中、东、西，穿境而过。有着得天独厚的交通和区位优势。
1985年三岔河镇就被吉林省政府确定为第一个小城镇综合体制改革试点单位；1994年被吉林省政府批准为“吉林省经济十强镇”；1995年被国家四部委确定为“国家级综合体制改革试点单位”。扶余区县分设后，县城迁至此处，三岔河镇更成了全县政治、经济、文化的中心。2001年三岔河镇被吉林省批准为中心镇，2002年三岔河镇又被命名为全国创建精神文明先进单位。2005年6月份，三岔河镇又被省文明委推荐为全国文明镇。2006年乡镇合并后，新城局农业示范园区又划归三岔河镇管辖。随着城镇基础设施的日趋完善，商贸流能更加活跃，文化、教育、金融、医疗等公共服务体系更加健全，经济快速发展的基础条件日趋成熟。
三岔河镇幅员262平方公里，镇区面积6.5平方公里，现有耕地面积18508公顷。辖5个街道，41个居民委，38个行政村，62个自然屯，全镇总人口111，713人，城区人口49，676人。
2005年全镇国内生产总值76027万元，实现一产增加值39112万元，二产增加值8443万元，三产增加值28472万元，全口径财政收入2800万元，农民人均收入达到3920元。
几年来，三岔镇通过实施县域突破战略，镇城经济得到了快速健康发展，呈现出种、养、加多业并进，新、奇、特精品叠出的强劲发展态势。到目前为止，已经形成了以食品制造、农畜产品加工为龙头，以木材加工、化工产业为依托、以效益农业、棚菜生产、林果生产、畜禽饲养、交通运输、白酒酿造业和劳务业为补充的十大主导产业。
三岔河镇现有2所高中，3所初中，18所小学，17所幼儿园。三星级宾馆1个，集餐饮、洗浴、娱乐于一体的综合服务中心4个，集健身、娱乐为一体的社区活动中心5个，医院3所，其中1所为县级医院。
石头城子古城址
石头城子古城址，位于吉林省松原市扶余县三岔河镇境内。距松原市区100公里，距扶余县城1公里。是辽代至金代时期的古城遗址，城址呈长方形，东西长500米，南北宽400米，城墙高5至6米，四周有护
历史沿革：
1938年为三岔河街。
1957年12月至1958年9月为三岔河镇，续而为三岔河人民公社。
1962年复为镇建制。
1992年撤销新安乡，合并至三岔河镇。
2005年撤销新城局乡，合并至三岔河镇，仍沿用三岔河镇。
名称沿用至今。