夫妻双方在做地贫基因筛查时大部分地区都是自费的，只有少部分城市是免费的。因为地中海贫血检查的步骤比较麻烦，如果是在孕期做该检查，就需要通过血常规、血红蛋白电泳等方法，而孕期做改检查，就需要通过基因检测技术明确α、b珠蛋白基因的异常位点，所以一般都要收，一般费用在300元-1000元之间。
而在广东、广西、海南等地区，地中海贫血是携带率最高的遗传性溶血性疾病，为了减少因为地贫导致的出生缺陷率，所以将这一项检查纳入了补助项目，所以是不收费的，不过前提是夫妇当中要有任何一方是广东省户籍或者持有效广东省居住证，并且在进行地中海贫血初筛检查时结果是阳性。总之，地贫基因筛查是否收费要看当地的相关规定，如果是自费的，具体的费用也是受到当地的经济、人均收入、医院级别、检测手段等因素的影响。不过需要注意的是，地贫筛查是一项基因检查，最好到口碑比较好、专业性较强的大医院进行，避免出现误诊等情况。