近年来，海洋渔业相关部门，推行“增殖放流＋强化执法”双重措施，去丰富候鸟的食物来源，保护深圳湾的自然资源环境和渔业资源。
每年6月6日，海洋渔业相关部门都会在深圳湾海域都会举办大型渔业资源增殖放流活动。据悉，仅去年，在深圳湾海域投放的虾苗就有150万尾，鱼苗30万尾。
禁渔六年来，市规划和自然资源局海洋综合执法支队也始终对深圳湾禁渔区保持高压执法态势，严查严管海上违法违规行为，查获并销毁900余艘“三无”船舶和170余万米非法网具，有效杜绝了非法捕捞，并减少非法渔具对鸟类的伤害。
据悉，近几年相关部门开展源头截污分流及末端截排集中处理等措施，促深圳湾海域水质提升。