城都地区的重要地点：
黑暗穴黑暗穴：是城都东部的连通洞，虽然只有一层，但是却被分成两个部分，并且有3个不同位置的出入口。洞穴最北端的出口在从烟墨市，如果是从北侧过来的话，会遇到一个池塘。
喇叭芽之塔喇叭芽之塔：这座塔采用柔构造建造，无论何时都是摇来摇去好像要倒的样子，但是实际上这更加有效地避免了地震等灾害对塔的影响。据传说是用一只超过30米高的喇叭芽建造了塔中央的通心柱。在塔中有很多正在进行修行的僧侣，他们一般使用喇叭芽。塔前是一个小湖，通过桥与市内连接。喇叭芽之塔为喇叭芽等神奇宝贝营造出一个良好的生活环境。
动画：在喇叭芽之塔，大危机中，小智一行人和训练家学校的学生们一起参观喇叭芽之塔。火箭队以将塔破坏而要小智交出皮卡丘。最后，小翔新收服的喇叭芽将被抓住的皮卡丘救出，皮卡丘最后使用十万伏特将火箭队打飞。
阿露福遗迹阿露福遗迹：是城都地区中央的一个遗迹，位在桔梗市西南。一旦解开入口处的拼图谜题，地下的大房间里就会充满了未知图腾。房间最里面的墙上会有未知图腾摆成的图案。如果沿着图案所指示的要求行动，就可以进入秘密房间解到有关未知图腾的历史。
阿露福遗迹是一个半开放式的遗迹区，地面上有四个解密石室，每个石室内都有一个拼图谜题。其中西面的两个解密石室需要从互联洞进入。
在外面有很多研究员正在研究这个遗迹，他们说这个遗迹远不止看上去那样简单，解决洞里的谜题之后一定会发生什么。一个研究员说这些图案的突然出现和新落成的神奇宝贝对话中心以及从那里发出的无线电波有关。
如果在遗迹附近或遗迹的石室内打开神奇宝贝齿轮的电台的话，在特定频道会听到神秘之声。神秘之声的一些杂音有疑似凤王的鸣叫，还有天界之笛的旋律。播放神秘之声可以增加遇到未遇到过的未知图腾的几率。
动画：动画中的阿露福遗迹出现在古代神奇宝贝公园，阿露福遗迹中。研究人员在此处挖掘到许多化石，其中一位人员是大木博士的学生佐竹。小智一行人来到了阿露福遗迹，遇到了被佐竹邀请的大木博士。佐竹让他们见证由自己发现的菊石兽和多刺菊石兽，并让他们保密。火箭队在附近湖旁取水中发现了一群菊石兽和多刺菊石兽，并打算献给坂木。最后被小智一行人打败。
互连洞互连洞：是城都地区南部的一个洞穴，地下有两个出口连接到阿露福遗迹，其最深处连接着大海。这里有时候不能向下行进，只能穿过洞窟去往桧皮镇。
呆呆兽之井呆呆兽之井：别名海兔之井，是桧皮镇东边的一口井。进入洞中，西边有一个小池塘，向北是一条单独的小径。底层是一个巨大的地下湖，湖中有一个小湖心岛。
从互连洞出来穿过道路就可以看到呆呆兽之井。井里面有很多野生神奇宝贝，其中最特别的就是桧皮镇的呆呆兽。在桧皮镇的传说中，400年前呆呆兽打了个哈欠，天降大雨，结束了长时间的干旱。在呆呆兽之井，邪恶的组织火箭队曾出现在这里，他们切下呆呆兽的尾巴，卖到位在卡吉镇的本部去。
呆呆兽之井外部动画：动画中的呆呆兽之井出现在桧皮镇的呆呆兽之井。火箭队穿过一个干旱地来到这里，但井里的水已经干涸。他们使用地鼠机器人来挖掘地下水并且抓走这里的呆呆兽。钢铁在听到传出奇怪的声音后来阻止火箭队捕捉呆呆兽。小智一行人在千惠的告知下前往此处。在小智攻击无果后，火箭队深入到地底更深处。之后呆呆兽群为救同伴来到了呆呆兽之井的上方使用了求雨。最终火箭队被赶出井外。
桐树林桐树林：是城都南部的一个森林，紧挨桧皮镇。森林枝繁叶茂，遮天蔽日，就算是白天也和晚上一样黑暗，数量庞大的虫属性神奇宝贝生活在其中。树林并没有草丛和普通地面的区别，在所有地方行走都有可能遇到野生神奇宝贝。如果想通过森林的话就必须要会居合斩。
在森林中央有一个男人，经常对树使用头锤撞击。在森林里还有一个祠堂，供奉森林之神时拉比，有很多事件都与这个祠堂有关。
动画：小智一行人从桧皮镇出发前往满金市的路上经过了这里。动画中的桐树林在桐树林，寻找大葱鸭中首次登场。小智一行人在这里认识到烧炭学徒尚人和他的大葱鸭，在火箭队三人组抢走大葱鸭后，小智一行人帮助尚人抢回大葱鸭。这里和游戏中一样有一个祠堂。动画中的森林比游戏中大得多，而且里面有人居住，甚至有一个小村庄和神奇宝贝中心。
满金电台满金电台：是满金市西边的一座六层的塔。紧挨磁浮列车站。这座塔最早原本是一座古老而巨大的木塔，后来因为腐朽而坏掉，在其上重新修建了电台，当时的塔崩坏的时候，据说在屋顶上发现了凤王和洛奇亚的彩羽和银羽。
一楼是前台接待处、二楼是营业部、三楼是总务部、四楼是制作室、五楼是台长办公室，六楼是瞭望台，工作室则分布在建筑内。广播电台每天都有若干个节目播出。曾经被火箭队占领，在这期间没有正常节目播出，而是火箭队宣言火：宣布历经三年在此复兴，并请求失踪的老大坂木现身。
新建的电台动画：满金电台出现在收讯塔的战斗，超越时空。小智在得到标准徽章之后在餐馆用餐时，遇到了阿岚。一行人受邀来到了电台广播采访。火箭队伪装成嘟嘟利堂艺人并不小心破坏了录音带。他们一起进行录制广播剧。在录制过程中，武藏即兴改了台词，而胡桃的圆场下，广播剧才得以继续。结果火箭队在录制最后偷走了神奇宝贝，胡桃和拍摄师也直播了小智战胜火箭队的全过程。
满金地道满金地道：是满金市地下的一条商业街，街上的商店会在不同时间开放。这里有美发兄弟开的理发店，中药店和一个销售贵重道具的商店。满金百货店的地下室连着地道。地道北端有一家照相店，训练家可以在那里装扮宝可梦之后拍摄纪念照片留念。
动画：在满金道馆，力量与速度中，小智一行人在小茜的带领下穿越地道前往百货公司。动画中的地道看起来比游戏设定要长很多。美发兄弟的理发店等游戏中的店铺也出现在动画中。
自然公园自然公园：是满金市北边的一个公园，这里是捕虫大赛进行的地点，神奇宝贝全能竞技赛巨蛋就在它旁边。公园主要分成两个部分。南边是一块休憩的空地，有几把长椅和一座花坛。北边是一大片草丛，半面是普通草丛，半面是高草丛，草丛和它中间的水池一起构成了一个精灵球的形状。自然公园在星期二、星期四和星期六召开捕虫大赛。主角可以通过参加捕虫大赛获得一些道具奖励。
动画：自然公园出现在捕虫大赛，在自然公园收服它！。小智在这里参加了捕虫大赛，且再次遇到奈奈，小智取得胜利获得日之石。
铃铛塔铃铛塔：是城都地区圆朱市东边的一座塔。凤王曾经栖息在这座塔的塔顶。要来到这里，需要经过铃音小道。铃铛塔曾经是凤王的栖息地，不过在圆朱市西边的另一座塔钟之塔被大火烧焦之时，凤王就离开了，并且从未回来过。铃铛塔被认为是一个神圣的地方，所以只有僧侣和带着凤王之羽的人才可以进入。很多训练家还是会来到这里，希望可以见证凤王的归来，但总是无功而返，直到主角在塔顶唤回了凤王。
七百年前，圆朱市修建了两座塔，分立东西两侧。这两座塔为了人类与神奇宝贝的友谊而修建，而塔顶的景色更是壮丽宏伟。东侧的塔用于唤醒神奇宝贝，而西侧的塔令神奇宝贝沉睡，凤王就居住在东侧的铃铛塔塔顶。
然而在150年前，一道闪电击中了西侧的塔，那座塔瞬间变成火海，大火燃烧了三天三夜，最后一场大雨扑灭了火焰，然而此时那座塔已经所剩无几。有三只不知名的神奇宝贝在大火中被烧死，凤王从天而降并使他们复活。
铃铛小道：从铃铛塔大门到铃铛塔的一段路，这里的树叶一年四季都是秋天的金黄色。
动画：铃铛塔出现在水君与米那君！凤王之传说！中。在顶楼有4个透明铃铛，每当凤王来临时，透明铃铛就会响起。而其他楼层中每层楼各有4个传达凤王意志的铃铛，共32个，火箭队在这集偷走了透明铃铛，在意外地打碎其中一个透明铃铛后，惹怒了许多宝可梦，虫属性宝可梦用吐丝把铃铛塔全部覆盖了。
在小松的叙述中，小松历代祖先祭祀宝可梦，为了让彼此共存共荣而守护铃铛塔。造访铃铛塔的凤王是和平的象征，能与凤王联系的人只有小松的祖先，然而在300年前，一些利用凤王的力量作恶的人，在争端中，铃铛塔被烧毁。于是凤王就离开此地，不与人类再有关系。圆朱居民期待着让凤王再次回到这里，而建立新的铃铛塔，但是凤王却没有现身。
烧焦塔烧焦塔：位于圆朱市西北，原本叫作钟之塔，和铃铛塔是一对，但是在150年前的一场大火中被烧毁，现在只剩下地面和地下一层。在传说中，洛奇亚曾经栖息在这里，但是当钟之塔倒塌的时候，洛奇亚往漩涡列岛飞去，与此同时，住在铃铛塔的凤王也飞离了那里，四处寻找拥有纯洁之心的训练家。在大火中，有三只不知名的神奇宝贝被烧死了，凤王在离开之前，将这三只神奇宝贝复活了。
故事开始的七百年前，圆朱市修建了两座塔，分立东西两侧。这两座塔为了人类与神奇宝贝的友谊而修建，而塔顶的景色更是壮丽宏伟。东侧的塔用于唤醒神奇宝贝，而西侧的塔令神奇宝贝沉睡，凤王就居住在东侧的铃铛塔塔顶。 然而在150年前，一道闪电击中了西侧的塔，那座塔瞬间变成火海，大火燃烧了三天三夜，最后一场大雨扑灭了火焰，然而此时那座塔已经所剩无几。有三只不知名的神奇宝贝在大火中被烧死，凤王从天而降并使他们复活。
动画：烧焦塔出现在烧焦塔，小松登场中，小智一行人为了挑战道馆误入了烧焦塔内，塔内的鬼斯和鬼斯通认为他们入侵了自己的住处，小智一行人受到了鬼斯的幻觉，小松出现制止了它们的行为，之后小智在塔内发现了凤王的标志，小松之后告诉了他们关于凤王、铃铃塔和烧焦塔的故事。而波克比在此时走入了烧焦塔深处。小松让鬼斯去寻找波克比和与其寻找的皮卡丘。
哞哞牧场哞哞牧场：这个牧场里放养大奶罐，并出产哞哞鲜奶。这里会有一些大奶罐生病，在喂给它们几个树果之后，会逐渐好转，其主人更是会赠送礼物作为感谢。在完全治愈它们后，主角可以在这里买到哞哞鲜奶。
除了一大片放牧用的牧场，还有一间谷仓，以及牧场主的家。牧场南边有围场，平时大奶罐们就在那里。谷仓旁边的房子是牧场主一家居住的地方。
动画：动画中的哞哞牧场主为哈瓦德。牧场位于满金市附近。在大奶罐，复仇之战，小茜带领小智一行人来到了哞哞牧场，他们品尝了此处大奶罐出产的哞哞鲜奶。之后小智和小茜展开了第二次的道馆战，小智获得胜利，取得了标准徽章。
光辉灯塔光辉灯塔：是浅黄市的地标性建筑物，位在浅黄市东边。灯塔里装有电梯，可以直接从顶层下降到底层。
动画：光辉灯塔出现在光辉灯塔！浅黄市的战斗。灯塔是用电龙的灯光来做导航，即使另建了其它的电力灯塔，这座塔依然没有被拆除，作为祈求安全的象征。之后光儿因为病情无法继续工作。
对战塔对战塔：是城都地区的一个对战设施。
动画：对战塔在光辉灯塔！浅黄市的战斗短暂出现过。火箭队误以为它是一座办公大楼，但被保安要求出示道馆徽章而无法入内。
漩涡列岛漩涡列岛：是城都大陆和湛蓝市之间一系列群岛。岛屿周围遍布漩涡，很难通过。在海面之下，一系列如同迷宫般的阴暗洞窟彼此相连，无论从海面上的哪个岛屿下行探索都有相当的难度。漩涡列岛过去是一个巨大的岛屿，有两个国家为了这个岛屿争吵。洛奇亚作为这座岛屿的守护者，失望至极，降下电光将岛屿斩为四块，然后消失在瀑布底端的尽头，期待着人类和神奇宝贝之间无形的信任可以再一次出现。
动画：漩涡列岛会举办漩涡列岛大赛，是一场三年举办一次的专门让水属性神奇宝贝训练家参加的比赛。
擂钵山擂钵山：是城都地区的高山之一，位于圆朱市与卡吉镇之间，擂钵山洞就在这里，其中有许多稀有的神奇宝贝，这里也是空手道王信彦的训练之处。
动画：小智一行人在雾中的九尾来到了擂钵山，经由擂钵山麓从圆朱市前往了卡吉镇，并在途中遇到了空手道王信彦与无畏小子。此外，擂钵山还是棒球电击兽队的象征之一。
愤怒之湖愤怒之湖：也被称作暴鲤龙之湖，是城都地区最北端的地点，位在卡吉镇北边。愤怒之湖主要是一片巨大的湖区，有为数不多的居民居住在附近。这里据说是城都地区最大的湖。湖的西边是一片巨大的树海迷宫，迷宫深处还有一栋房子。湖区除了周三，每天都在下雨。下雨的时候，湖区会变成一片泽国，雨停了以后水位就会下降。
据说曾经有许多的暴鲤龙来到这里降下暴雨，被雨水填满的火山口变成了愤怒之湖。湖中央可以遇到异色的暴鲤龙。异色暴鲤龙是因为火箭队的实验而被迫进化的狂躁的宝可梦，进化之后开始四处破坏船只、袭击游泳者，附近的居民也因此不敢接近愤怒之湖。
动画：怒之湖出现在阿渡与红色暴鲤龙和红色暴鲤龙之愤怒。火箭队执行了R计划实验，一只鲤鱼王受到实验影响被强制进化为红色暴鲤龙，在捕捉红色暴鲤龙的计划被小智一行人和阿渡挫败后，阿渡收服到了红色暴鲤龙。
火箭队基地火箭队基地：是隐藏在卡吉镇商店地底的火箭队秘密基地。一段时间，火箭队利用基地作为电源，发射出高频音波，使卡吉镇、愤怒之湖和周围的其它地点的宝可梦感到不安，并影响了他们的进化规律。他们试图让愤怒之湖的鲤鱼王进化，因为暴鲤龙比前进化形罕见很多，这样会使得他们获利