新国内航站楼是舟山国际空港建设的核心工程，建筑面积约1.7万平方米，双层式布局，建筑设计以简洁实用为原则，融国际先进理念和海天佛国文化于一体，打造高品质的候机环境。
总高度24米，前列式构型，二层式布局,三座廊桥，8个值机柜台。
一层为国内到达区，主要包括迎客厅、行李提取厅、行李处理用房、远机位候机厅等，并设置相配套的商业、服务、业务及设备用房等。
二层为国内出发区，主要包括国内值机办票区、安检区及候机厅，并设置相配套的商业及设备用房等。
颇具地域特色的建筑外形，宽敞豪华的候机大厅，与国际接轨的现代化设施和服务，都将极大提升新区旅客的乘机体验。
新航站楼启用，游客们这样评价：
福建泉州林女士：整个机场不一样了，这个是新的开的感觉环境很好，空气也很好。
张先生：我是从呼和浩特来的，感觉挺整洁，感觉环境也挺好。挺好、挺好，不错。
王先生：今天过来刚好有一个新的航站楼启用，所以我们也挺幸运的。也挺方便的，感觉挺好的，挺漂亮。
舟山市首任民航管理局局长叶胜利：
1997年8月8日开通时，只有两条航线，那个时候第一个航班是浙江航空公司的杭州飞舟山和温州飞舟山。
21年间，随着舟山改革开放步伐的不断加快，舟山民航事业也快速发展。
舟山普陀山机场的通航城市从省内两个，逐步拓展到北京、上海、深圳、厦门、连云港、青岛、济南、广州、福州、天津等18个城市。年旅客吞吐量则从20万突破100万。
随着中国（浙江）自由贸易试验区的快速推进，今年1—7月份，旅客吞吐量达到了71.12万人次，同比增长21%，增幅位居全省前列。
舟山民航集团董事长王行跃表示：
新航站楼的启用，不单单是一个新楼老楼之间的转换，对机场来说也是一个管理、服务水平一个比较全方位的提升。
我们从管理水平、服务水平、现代化水平、国际化水平都要有一个大的进展和跨越。
具体来说，一个我们还是要对标先进的机场，要转到现在先进、规范化，甚至国际化的管理模式。第二个就是在服务方面要深入开展民航服务质量提升的这样一个工程，全方位的提升服务的水平。
1997年，就是21年前，咱们舟山机场成立了航站、开通了民航的航班，可以说1.0版。
今天，21后的今天我们新的航站楼投运，所以我称为2.0版，开启了我们舟山机场的新时代。
据了解，舟山国际空港建设是浙江省机场建设和舟山市“1128”大行动的重点工程之一，是波音项目的配套工程，总投资约13亿元，主要包括航站楼改扩建及配套设施建设、国际航站区改扩建、飞行区改扩建项目。
待航站区整体工程完工后，机场将拥有总计约2.8万平方米的航站楼，可满足200万以上客流量的航线运营需要。
浙江省机场集团有限公司党委副书记、总经理郑向平
我们省机场集团对舟山机场的发展也非常地重视，把它作为对外开放的非常重要的机场。
接下去的2.0版，我想主要有三个方面：
第一个我们要尽快地把口岸验收通过，成为我们的一个国际机场。
第二个，我们新的航站楼建好了，我们希望在舟山机场开通