上方山位于北京房山西部，地处太行山北缘，北京西山中段，古称大房山，主峰紫云岭860 米。园区内自然、文化双脉资源特色明显，以“九洞、十二峰、七十二庵”享誉古今，有畿辅奇境之盛誉，是中国名山。
地质遗迹资源：上方山是中国北方喀斯特分布典型地区，是2012 年公布的中国北方喀斯特地貌遗产的重要组成部分。早在1902 年，法国地质学家普意雅在这里测绘了云水洞，30 年代中国地质学家尹赞勋写了《北京云水洞》一书。这一地区主要是石门背斜形成的岩溶地貌，公园内的峰、谷、洞、坑、崖、崮等地质遗迹资源类型丰富，天柱峰是典型的岩溶孤峰，龙虎峪是典型的峡谷，天坑是中国北方首次发现的地质遗迹。最为典型的是地质变迁形成的云水洞，是目前世界相对海拔高度最高的水平溶洞，属新生代第四纪地质遗迹，石钟乳、石笋、石幔、石柱、石花等沉积物类型齐全。第二厅的石笋，高38 米，在世界溶洞景观中堪称奇观。1980 年在洞中发现古生物化石，经当时中科院贾兰坡院士鉴定为与周口店北京猿人遗址同属一个地质时期的生物化石，具有很高的科研价值。
森林资源：上方山森林属原始天然林，是北温带低海拔落叶阔叶林和针叶阔叶混交林，以古柏、古栎、青檀群落为主，森林覆盖率95% 以上，有植物110 科、369 属，652 种，其中有小叶中国蕨、黄檗、绶草等国家重点保护植物10 种，有槭叶铁线莲、拐枣、野生流苏等北京市重点保护植物21 种，有房山翠雀、房山紫堇、上方苔草等独有特有植物23 种，有槐、柏、松、檀等古树18 种万余株，其中汉柏、辽松、宋国槐、金银杏、元菩提、明古檀等树王独领风骚。有陆生野生动物149 种，其中两栖动物2 种、爬行动物7 种、兽类35 种、鸟类105 种，国家级重点保护动物18 种，北京市级重点保护动物80 种。
历史文化资源：上方山集儒、道、佛文化于一域，自古是历史文化名山。史料记载佛教历史有1960 余年(东汉光武10 年)，有寺、庵、碑、塔、摩崖石刻、名人诗词题字等200 余处。目前完好的寺庵有兜率寺、华严洞、藏经阁等26 处，有寺庵遗址药师殿、普贤殿等18 处，有佛殿壁画22 幅、石碑石刻20 处、石经幢53 通、古塔57 座、古井11 眼、古桥5 座、古云梯1 座。历史上珍藏的两套大藏经、明刻四十二章经、当代华严祖师肉身舍利，称为上方山“佛界三珍”。