西宁南关清真寺于1934年建造，总面积为3100平方米，有砖混结构礼拜大殿五间，二层砖混结构东房八间，二层北房十四间，二层西房十二间，水塘七间以及一座高约15米的唤醒楼。当年这里人烟稀少，附近的回族群众要到东关清真大寺做礼拜，很不方便，于是当地民众集资修建了土木结构的西房三间，作为礼拜大殿，北房三间为学生房并请买成章阿訇任教。随着南关地区人口增加，清真寺也逐渐扩修，形成较大的规模。宗教改革后这里曾作为西宁刺绣厂厂房，后又被城东区南小街小学所占用，直到1979年房屋归还给清真寺才又重新进行整修扩建形成今天的规模。