唐太宗游飞龙，灵签验玄武，唐初武德四年，当时身为秦王的李世民，奉命飞兵东进虎牢关，阻止黄河北夏王窦建德渡河援救被困洛阳的郑王王世充，李以三千骁勇大败窦兵十万，生擒窦王于牛口峪，大获全胜后，扎营于今日的枣树沟秦王寨{秦王寨村名.窦王碑流传至今}，一天，李世民信步出寨，只见东南方烟雾缭绕烘托一峰，甚为壮观，李便登上峰巅，举目远望，山河一览，尽收眼底，联想近日战绩，不由仰天大笑。这一笑惊动了一位道长，抬头望去，只见峰顶站立一人，气宇轩昂，相貌不凡，笑声起处，彩虹烂漫，金光闪烁，道长望顶峰躬身叩拜，李世民见状，疾步下山，道长邀李世民洞中谈话，两人一边喝茶一边谈话，李世民问此峰来历，道长将九位太子在此升天的故事讲罢，李世民咏出；“九顶烟霞聚仙峰，去天尺五，一沟云雾环帝座，拔地寻千。”道长听罢拍手叫好，这便是后来镌刻在飞龙顶紫云宫的楹联流传至今。
明朝朱元璋登帝之后，极为迷信，他为了巩固统治地位，大肆修造庙宇，兴五斗米道，是历史上道教最兴旺时期，当时派一大臣对全国庙观视察，查看后交旨皇上；“南有武当，北有广武山飞龙顶，乃全国三十六顶之冠也”。飞龙顶是一个建筑雄伟，巍峨壮观的大型建筑群，并且有美妙的自然景观，和生动的神奇传说，如喞喞鸡，哗之井，群羊助金顶，鲁班显圣，老君显灵等列不胜举。
可惜一个规模较大的历史悠久的名观，在文化大革命期间遭到了严重的破坏。成为一片瓦砾。