(1)内地居民单独申请往来港澳通行证
①填写《中国公民出入境证件申请表》(资料办理窗口);
②提交符合《出入境证件相片照相指引》标准的申请人照片(资料现场拍摄);
③交验申请人居民身份证原件，申请人未满 16 周岁也可交验居民户口簿，军人应交验军人身份证明。上述身份证件须留存复印件或者电子扫描图片;
④按规定提交或者核验指纹信息;
⑤军人、登记备案的国家工作人员，应当提交本人所属单位或者上级主管单位按照人事管理权限审批后出具的同意办理出入境证件的函。未实行按需申领护照地区的内地居民，还须按照有关规定出具相关证明材料。
(2)内地居民申请往来港澳签注
①填写《中国公民出入境证件申请表》(资料办理窗口);
②有效往来港澳通行证(同时申请往来港澳通行证的除外);
③内地居民按照中华人民共和国出入境管理局有关规定在非常住户口所在地申请往来港澳签注的，还须提交符合在非常住户口所在地申请条件的证明。军人、登记备案的国家工作人员，应当提交本人所属单位或者上级主管单位按照人事管理权限审批后出具的同意办理出入境证件的函。未实行按需申领护照地区的内地居民，还须按照有关规定出具相关证明材料;
④内地居民按照国家移民管理局有关规定在非常住户口所在地申请往来港澳签注的，还须提交符合在非常住户口所在地申请条件的证明。军人、登记备案的国家工作人员，应当提交本人所属单位或者上级主管单位按照人事管理权限审批后出具的同意办理出入境证件的函。未实行按需申领护照地区的内地居民，还须按照有关规定出具相关证明材料;
⑤内地居民同时申请往来港澳通行证和签注的，无须重复提交相关材料。