在降星镇与黑暗路基艾尔的决战后,银河奥特曼离开已经过去2年的时间……地球再度受到某人的威胁。仿佛被大地的悲鸣所引导,礼堂光和银河奥特曼再度融为一体,银河奥特曼终于要回来了!敌人的目标是,埋藏在地底深处名为“维科特利姆”的水晶矿脉。但是,在地底还有着我们所不知道的生命存在!他们是自远古时代的“维克特利安”,守护着维克特利姆水晶在地底和平地生活着。在维克特利水晶的危机中,维克特利安的女王将神秘的道具·维克特利圣枪授予青年翔,并派他前往地面。他要和维克特利奥特曼一体化,为了拯救地底而战!在地球上也有应对所有超常现象危机而形成的超常现象特搜组织“UPG”。结成不久的队伍和小光相遇。小光的冒险精神为新的伙伴和新的战斗舞台做好了准备!小光和翔,银河奥特曼和维克特利奥特曼……在命运的引导下两人的遭遇,其结果究竟会如何发展呢?