王沟村位于南长山镇北部东侧，三面环山，东临海。村庄呈方块状聚落，现有人口796人，267户。村民主要从事海水养殖、海洋捕捞、渔家乐旅游等。
相传唐王东征路过长岛，因去竹山岛游玩，被风浪阻隔不能回返，留在岛上的文武官员每日到该村东面的海边眺望，盼唐王归来，此地因而得名望驾沟，后演绎成王家沟，简称王沟。据《许氏族谱》记载：清顺治年间，许、张姓分别从蓬莱许家、草店迁入建村。
王沟在清道光年间属王沟社，为社驻地。1928年属连城社，1934年属连城乡，1945年属玉石区，1948年属中正乡，1949年属玉石乡。1956年成立玉石乡长海社，1958年称玉石大队长海生产队，1962年改称南长山公社长海大队，1964年改称王沟大队，1984年撤销大队建立行政村。