民宿通常指家庭在自家经营的家庭旅馆式住宿设施，即将房间以适中的价格出租给游客。民宿通常位于郊区以及度假村和景点附近，类似于提供住宿与早餐的设施，能让预算有限的旅客有机会亲眼目睹日本家庭的生活。
客房通常（但不一定）有榻榻米地板和被褥。与传统旅舍和日式旅馆一样，客房用品也已准备好。卫浴设施通常要共享，而且您通常需要自行收好寝具。
通过民宿深入了解日本家庭的生活其它经济实惠的住宿设施公寓型民宿是更为优雅的住宿选择，通常介于家庭氛围的民宿与更高档次的酒店之间。公寓型民宿通常为西式，地点靠近滑雪场及其它度假区。
家庭旅馆与青年旅舍类似，是服务中长期旅客的住宿设施。房型有多人间和单人间，厨房、浴室和公共区域则需共享。
东京、京都及其它都市的家庭旅馆有时会有内部餐厅、酒吧或咖啡厅，也开放给非住客的游客和观光客。
家庭旅馆的房费视房型而定。
简约舒适的住宿设施青年旅舍日本大约有 220 间国际青年旅舍。订房时必须加入此联盟并缴纳一小笔会费。
标准房型为四到六床的宿舍。不过，一些国际青年旅舍有家庭房，部分旅舍甚至另外提供单人房和双人房。大多数旅舍提供男女混住的住宿设施，也会以楼层区分男女。公共区域和浴室需共享。
虽然名称叫作青年旅舍，但青年旅舍欢迎所有年龄的背包客和游客入住。在东京、京都和其它都市，一些青年旅舍经过翻修，设置了内部餐厅或酒吧，营造出一种家庭的感觉。郊区甚至可在寺庙住宿。最基本的宿舍床位价格通常为每晚 3,500 日元起。某些青年旅舍可能有宵禁，还请多注意。
对于预算有限的游客，日本还有很多其它的住宿设施，例如：胶囊旅馆、寺庙寄宿（宿坊）以及走低价路线的日式旅馆等等。