车内空调温度夏季应为21-25℃，冬季应为25-28℃最合适。这是汽车空调行业制定的汽车舒适性环境指标，且车内温度与外界环境温度不能差距太大。最理想的车内车外温差，轿车在10℃范围内，大型客车在8-12℃范围内。长时间使用空调的，可定时将车窗打开些缝隙，保证车内空气新鲜，以避免得空调病。
夏天停放在烈日下的汽车，车内温度可能高达摄氏六七十度，这时应先把车门、车窗打开，等两三分钟热气排出后再坐进去发动汽车，且不要急于关上车窗，先打开空调外循环，待车厢内外温度相近时，再关闭车窗，启用内循环。这样虽然开始时热了点，但避免了发动机启动时过大的负荷，同时空调压缩机也能很快进入到最佳工作状态，所以是最好的选择。
另外，内循环使用时间长了会造成车内空气含氧量降低，发动机不完全燃烧产生的一氧化碳等有害气体也可能在车内累积，所以必须适时定期切换到外循环模式，让车外的新鲜空气吹进来。同时，空调出风口的方向也很有讲究。开冷气时将出风口向上，因为冷空气会自动下沉的。另外，空调温度不要调得太低，风速不要太小。自动恒温空调一般车厢内外温差不要超过10℃。非恒温式空调，可先把冷气温度设在最低，风速开到最大，等觉得冷时再把温度调高一点，把风速降一挡，如还冷，再将温度调高些，然后将风速降下来，反复这样才是正确操作。