1、东部金沙索道入口：三清山索道入口，只能乘坐索道上下，徒步上山需从此处乘坐摩托车抵达东部玉灵观入口，费用50元/人。索道下站后直达三清山精华景区——南清园景区，一日即可往返。
2、南部外双溪入口：徒步首选入口，也可乘坐索道直达也是最早的登山入口，从南部徒步起始点到索道上站为止，全程2.5公里，需时1-2小时，登山距离最短，沿途可以欣赏到三清山冰凉的溪水和溪石，也是最陡，最耗体力的。如需要游览山内精华景区需时2天。
3、玉灵观入口：在东部或者汾水的，大部份选这条路，这条路全程6公里左右，步行需要3-4小时，从玉灵观到三清宫景区大约得走2-3小时，从玉灵观到风门这一路没什么景，从风门到三清宫这一路上还有一些小景点（结须岩、锯解石、一些道教小雕刻等），这条路也是香客最常走的路，因为到三清宫最近。但这条线路相对冷清，没有车子直达，只能到环山公路边。
玉灵观入口登山路线：三清山东部索道口——玉灵观——西海岸——阳光海岸——郁松林（第一天露营点）——郁松林——玉京峰——阳光海岸——南清园——三清山东部索道口（旖旎乱天下 提供）
4、金女线：由三清山金沙服务区游步道验票站登山入口处上山至南清园景区巨蟒出山，女神峰景点为止。这条线路也叫金女线，离索道入口有一些距离。此线全长4.22公里，相对高差约1000米，登山步行所需时间3-4小时。是三清山的申遗线，三清山的水资源景观主要集中在这条登山线路上，这条路清幽淡雅，拥有最深刻的历史内涵。但现在已经关闭，但可以选择上山之后择道下山。