历史上，真正见过张择端真迹之人少之又少，而不断有人持续画出《清明上河图》。大多数作品不得按照复制本（甚至是再复制品）描绘,也总是靠想象来完成，所以《清明上河图》各版本间的差异很大。
总体来说说，《清明上河图》大致可以区分为3大系统。分别是：张择端的真迹、明代仇英的“仇英本”和清代宫廷画家的“清院本”。
宋代版本
宋 张择端《清明上河图》 现藏北京故宫博物院
这是现藏于北京故宫博物院的清嘉庆《石渠宝笈三编》著录本《清明上河图》。从宋到今，流传有序，卷后的题跋、印鉴历历可数，被绝大多数人认为是张氏的真迹。
宋 张择端《清明易简图》 现藏台北故宫博物院
在画卷尾端的山石上有“翰林画史臣张择端进呈”签名，有学者认为其代表“金人入主汴京时的短时间风格“。”易简“，语出《易经．系辞》：“易则易知，简则易从。”即平易简单之意，作者希望透过画面，让观者对都城繁华胜景一目了然。
宋 张择端《清明上河图》 现藏台北故宫博物院
相传为张择端所绘。因有人认为：“该卷本与明清仿本风格迥异。”
元代版本
元人《清明上河图》 香港私人藏
此为工笔重彩本。专家认为，这是介于宋本与明清仿本之间的元本，另有三颗元印作为证据。
元秘府本《清明上河图》 传藏于美国芝加哥孟义君处
董作宾先生研究确定此本为真本，并为其书写了序文、跋和编校后记。
元人《清明上河图》 现藏台北历史博物院
传元人所作，又称白云堂本。原为艺术家黄君璧所藏，后赠予台北历史博物馆。
明代版本
明 仇英《清明上河图》 现藏辽宁省博物馆
仇本《清明上河图》虽为仿品，但融入了自己的想象与创作。比如在此图中，张择端画中的木质虹桥已经被仇英笔下的石拱桥取代，桥上市景已由张本的几个草棚凉亭演变为木质售货亭。
明 仇英《清明上河图》 现藏台北故宫博物院
这是仇英所绘《清明上河图》的另一版本，随蒋政府迁至台湾，现藏于台北故宫博物馆。
传明 仇英《清明上河图》 现藏台北故宫博物院
本卷有多处与其它版本不同。重彩设色亦是其它作品所无，幅中大量运用了石青、石绿、朱砂、藤黄、胡粉及紫色等颜料，画面呈现出浓烈瑰丽的风格。这很出自明代“苏州片”画家对仇英风格的刻意追摹。
明 仇英《清明上河图》 保利拍品
这是保利拍卖网上的一幅仇英《清明上河图》，其构图与台北故宫收藏的仇本几乎一致。
下面的几幅明本《清明上河图》在大英博物馆中可以见到：
大英博物馆是世界三大博物馆之一，是收藏中国流失文物最多的一家，竟达2.3万件。
清代版本
清院本《清明上河图》 现藏台北故宫博物院
此本由清宫画院的五位画家——陈牧、孙祜、金昆、戴洪、程志道参照各朝的仿本协作画成，故之清院本。
清院本是集各家所长，又受西洋画风影响，街道房舍均以透视原理作画，并有西式建筑行置其中。此画充分地展现了清初民俗风情，堪称院画中的精品之作。
清 沈源《清明上河图》 现藏台北故宫博物院
此本以水墨为主，在用色方面，更只用赭色稍加钩染，自有一番清新雅淡的韵味。用笔熟练，界画桥梁、屋宇、人物皆极为精细工整，亦清画院中之佳作。
清 罗福旼《清明上河图》 现藏北京故宫博物院
此图以宫苑为主体进行精致描绘，突出了相关活动的实景所在。在构图上运用透视手法，形成了画面世界真实化的效果。
清人画 仇英《清明上河图》 现藏美国弗利尔美术馆
清 佚名《仇英清明上河图》 现藏美国大都会艺术馆
《清明上河图》，为历代中国人所喜爱，而现今的艺术家更是将此与其它艺术相融合，使其呈现出更加立体、生动的效果。
比如十字绣《清明上河图》：
还有木雕版的：
泥塑的更是栩栩如生：
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