1908年4月，俄国外阿穆尔铁道兵旅团管弦乐团在哈尔滨演奏了柴可夫斯基的《1812序曲》，拉开了中国历史上第一场交响乐音乐会的序幕。这支乐团后被改编为中国第一支交响乐团——中东铁路俱乐部交响乐团，这支当时以俄罗斯侨民为主组成的乐团，是哈尔滨交响乐团的前身。
近年来，哈尔滨交响乐团与众多国内外著名指挥家合作。其中有祖宾·梅塔、安纳托利·列文、阿列克谢·波格拉德、郑小瑛、汤沐海、陈燮阳、李心草、杨洋、蔡金冬等。
2009年，哈尔滨交响乐团随哈尔滨市政府代表团，先后在丹麦奥胡斯市音乐厅、奥地利维也纳金色大厅、希腊雅典国家大剧院进行友好访问演出，之后又出访俄罗斯、日本等地。2016年，受联合国和平大会邀请，由哈尔滨交响乐团与乌拉尔模范爱乐乐团组成的百人乐团在万国宫上演联合国和平大会“友谊之声”交响音乐会。
2011年，哈尔滨音乐厅与哈尔滨交响乐团厅团合一，按照国际化的运营管理模式，为打造职业化乐团制定了详细的排练演出计划及长远的发展目标。哈尔滨交响乐团每年在完成冬、夏两个音乐季演出的同时，也成功完成了历届中国·哈尔滨之夏音乐会、哈尔滨新年音乐会、中国·哈尔滨冰雪节、中俄博览会、中俄艺术节等系列音乐会的演出。乐团现有数位俄罗斯优秀职业艺术家加盟，可以更好地诠释俄罗斯作品，也提升了哈尔滨交响乐团的国际化水准。