巧家药山国家级自然保护区国家级森林生态系统类型自然保护区。林业部门管理。位于云南省巧家县境内。主峰轿顶山，海拔4041.6米，是金沙江流域进入长江前的最高峰。保护区总面积20141公顷。始建于1978年， 1984年4月建立药山省级自然保护区，2005年升为国家级。药山在植物分布区类型划分中属于中国-喜马拉雅森林植物亚区和中国-日本森林植物亚区的结合带，处于华中地区和云贵高原之间。因其历史的悠久，地貌的多样，富含古老的和过渡的植物区系成分而成为联系中国种子植物特有属三大分布中心（川东-鄂西、滇黔桂和横断山）的关键地区之一。
区内记录有维管束植物193科695属2400余种。其中国家Ⅰ级保护植物有巧家五针松、南方红豆杉、攀枝花苏铁、珙桐等，其中巧家五针松为极度濒危物种。国家Ⅱ级保护植物有20多种。记录有陆栖脊椎动物262种。其中国家Ⅰ级保护动物有豹、金雕、黑颈鹤等，国家Ⅱ级保护动物有27种。野生药用植物有天麻、杜仲、贝母等836种。主要保护对象是东部和西部植物区系过渡性质的常绿阔叶林，巧家五针松原生地，亚高山地区沼泽化草甸湿地生态系统及动物、植物、药物资源。