在收服绿毛虫之后，小智在无印篇第3话中又成功收服“比比鸟”。虽然跟随小智后，比比鸟的战绩一直是胜少输多，切之后还沦为“工具鸟”。
但后来为保护波波群，比比鸟孤身迎战大嘴雀，虽身受重伤但也因此进化为比雕，最终不仅击败大嘴雀并成功驱赶烈雀群，还就此成为波波们的守护者。
最终，比雕在82话正式与小智告别。
“离队特训”的火爆猴
无印篇25话“火爆猴”初登场，它与小智可谓是不打不相识。因为脾气火爆热衷于打架，故此被小智带到「P1格斗大赛」中参赛，在经过一番苦战后火爆猴顺利夺冠。
而后在29话，善于训练格斗系宝可梦的扇斗建议将火爆猴留在他身边特训，小智接受建议后便将火爆猴留下，之后就再未重聚。
“回归族群”的乘龙
比雕离队后不久，“乘龙”在无印篇85话正式登场，当时脱离族群的它正受流氓欺负，被小智一行人成功解救后自愿成为小智的宝可梦。
在此之后，小智并未让年幼的乘龙参与对战，而是经常让它参与充满趣味性的比赛。
而在114话中，乘龙遇到家人。为了让它回到妈妈身边，小智就此让它离队。此后小智曾与长大后的乘龙再次相遇，并一同击败火箭队，后来乘龙还因此成为乘龙族群的头领。
与神兽一同“消灭巨大植物”的甲贺忍蛙
XY第1话“呱呱泡蛙”登场，那是它第一次见到小智，后来，为救被火箭队控制并狂化的烈咬陆鲨，呱呱泡蛙与小智首次合作，之后由心认同小智的它主动成为他的宝可梦。
XY&Z第46话，神兽基格尔德来到小智和甲贺忍蛙面前，并提出希望能借助甲贺忍蛙的力量消除巨大植物的请求，之后甲贺忍蛙接受使命，虽然不舍，但尊重甲贺忍蛙选择的小智还是答应。
至此，甲贺忍蛙正式宣布离队，此后也再未与小智重聚。
“湿地安身”的黏美龙
XY55话“黏黏宝”登场，为了变得与皮神一样强，便自愿跟随小智。
后来，成功变强的黏美龙也凭实力赢得了多次对战的胜利。
旅途中，黏美龙与小智曾有过三次离别与重聚，在最后一次，它才在湿地安身并彻底离小智的队伍。
“反回故乡”的毒贝比
太阳&月亮篇中“毒贝比”早在55话就已经出场，但67话才自愿成为小智的宝可梦。
虽然毒贝比入队，但小智却从未让它与其他宝可梦战斗，后来还亲自送它返回故乡，之后顺利进化为四颚针龙的它虽然多次主动回归帮助小智，但最终还是含泪分别回到故乡。
除以上七只宝可梦外，小智曾用巴大蝶与拉达进行交换，但还没握热乎，就因为担心巴大蝶而反悔。
皮卡丘不在身边的日子里，长尾怪手一直陪伴小智左右，中途小智虽然用长尾怪手与小光换了泳圈鼬，但后来因为长尾怪手太热爱「宝可梦乒乓」活动，故此才以成为正式选手为目标留在训练中心。（每当会想到这事，都觉得小光吃了个大亏。）
捕虫大会上，小智抓到一只大针蜂，因为喜欢黑黄条纹的奈奈很中意大针蜂，故此将其送出。而有着相同命运的还有“虫电宝”，小智前一秒抓到它，后一秒便当做离别赠礼送给自己的小伙伴了。
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